apo_ref6 - reference 6

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Number of sequences              46

Key:

A	APO repeat - type A
B	APO repeat - type B
C	APO repeat - type C
D	APO repeat - type D
E	APO repeat - type E
F	APO repeat - type F
G	APO repeat - type G
H	APO repeat - type H
I	APO repeat - type I
J	APO repeat - type J
K	APO repeat - type K
L	APO repeat - type L
M	APO repeat - type M
U	APO repeat - type unknown

Sequence Name	# Repeats
		80	101	102	123	135	156	157	178	179	200	201	222	223	244	245	266	285	306
ape_human	9	D		B		B		B		B		G		H		B		B
		64	85	86	107	119	140	141	162	163	184	185	206	207	228	240	261
AP11_ONCMY	8	A		B		B		B		B		B		B		B
		64	85	86	107	119	140	141	162	163	184	185	206	207	228	240	261
AP12_ONCMY	8	A		B		B		B		B		B		B		B
		67	88	89	110	122	143	144	165	166	187	188	209	210	231	243	264
APA1_ANAPL	8	C		B		B		B		B		B		B		B
		67	88	89	110	122	143	144	165	166	187	188	209	209	230	242	263
APA1_BOVIN	8	C		B		B		B		B		B		B		B
		64	85	86	107	119	140	141	162	163	184	185	206	207	228	240	261
APA1_BRARE	8	A		B		B		B		B		B		B		B
		67	88	89	110	122	143	144	165	166	187	188	209	210	231	243	264
APA1_CANFA	8	C		B		B		B		B		B		B		B
		67	88	89	110	122	143	144	165	166	187	188	209	210	231	243	264
APA1_CHICK	8	C		B		B		B		B		B		B		B
		67	88	89	110	122	143	144	165	166	187	188	209	210	231	243	264
APA1_COTJA	8	C		B		B		B		B		B		B		B
		68	89	90	111	123	144	145	166	167	188	189	210	211	232	244	265
APA1_HUMAN	8	C		B		B		B		B		B		B		B
		68	89	90	111	123	144	145	166	167	188	189	210	211	232	244	265
APA1_MACFA	8	C		B		B		B		B		B		B		B
		67	88	89	110	122	143	144	165	166	187	188	208	208	229	241	262
APA1_MOUSE	8	C		B		B		B		B		B		B		B
		67	88	89	110	122	143	144	165	166	187	188	209	209	230	242	263
APA1_PIG	8	C		B		B		B		B		B		B		B
		67	88	89	110	122	143	144	165	166	187	188	209	210	231	243	264
APA1_RABIT	8	C		B		B		B		B		B		B		B
		67	88	89	110	122	143	144	161	162	183	184	204	204	225	237	258
APA1_RAT	8	C		B		B		B		B		B		B		B
		64	85	85	106	118	139	140	161	162	183	184	205	206	227	239	259
APA1_SALSA	8	A		B		B		B		B		B		B		U
		64	85	86	107	119	140	141	162	163	184	185	206	207	228	240	261
APA1_SALTR	8	A		B		B		B		B		B		B		B
		64	85	86	107	119	140	141	162	163	184	185	206	207	227	237	258
APA1_SPAAU	8	U		B		B		B		B		B		B		B
		67	88	89	110	122	143	144	165	166	187	188	209	210	231	243	264
APA1_TUPGB	8	C		B		B		B		B		B		B		B
		60	81	82	103	115	136	137	158	159	180	181	202	203	224	225	246	247	268	287	308	309	330	331	352	353	374
APA4_HUMAN	13	D		B		B		B		B		B		B		B		B		B		B		E		F
		60	81	82	103	115	136	137	158	159	180	181	202	203	224	225	246	247	268	287	308	309	330	331	352	353	374
APA4_MACFA	13	D		B		B		B		B		B		B		B		B		B		B		E		F
		60	81	82	103	115	136	137	158	159	180	181	202	203	224	225	246	247	268	287	308	309	330	331	352	353	374
APA4_MOUSE	13	D		B		B		B		B		B		B		B		B		B		B		E		F
		44	65	66	87	99	120	121	142	143	164	165	186	187	208	209	230	231	252	271	292	293	314	315	336	337	358
APA4_PAPAN-F	13	D		B		B		B		B		B		B		B		B		B		B		E		F
		60	81	82	103	115	136	137	158	159	180	181	202	203	224	225	246	247	268	287	308	309	330	331	352	353	374
APA4_PIG	13	D		B		B		B		B		B		B		B		B		B		B		E		F
		60	81	82	103	115	136	137	158	159	180	181	202	203	224	225	246	247	268	287	308	309	330	331	352	353	374
APA4_RAT	13	D		B		B		B		B		B		B		B		B		B		B		E		F
		79	100	101	122	134	155	156	177	178	199	200	221	222	243	244	265	284	305
APE_BOVIN	9	D		B		B		B		B		G		H		B		B
		67	88	89	110	122	143	144	165	166	187	188	209	210	231	232	253	254	275
APE_BRARE	9	D		B		B		B		B		B		B		B		B
		74	90	90	111	123	144	145	166	167	188	189	210	211	232	233	254	273	294
APE_CANFA-F	9	D		B		B		B		B		G		H		B		B
		74	95	96	117	129	150	151	172	173	194	195	211	212	233	234	255	267	288
APE_CAVPO	9	D		B		B		B		B		G		H		B		B
		11	32	33	54	66	87	88	108
APE_MACMU-F	4	D		B		B		B
		1	22	23	44	56	77	78	98
APE_SAISC-F	4	D		B		B		B
		59	80	81	102	114	135	136	157	158	179	180	201	202	223	224	245	246	267	268	289	290	311	312	333	334	355	356	367
O93601	14	D		B		B		B		B		B		B		B		B		B		B		B		E		F
		60	81	82	103	115	136	137	158	159	180	181	202	203	224	225	246	247	268	287	308	309	330	331	352	353	374
Q01488	13	D		B		B		B		B		B		B		B		B		B		B		E		F
		4	25	26	47	48	69
Q28857-F	3	B		E		F
		67	88	89	110	122	143	144	165	166	187	188	209	210	231	232	253	254	275
Q9PT02	9	D		B		B		B		B		B		B		B		B
		15	36	37	58	70	91	92	113	114	135	136	157	158	179	180	201	202	223
Q9PT73-F	9	D		B		B		B		B		B		B		B		B
		48	69	72	93	105	126	127	148	149	167	167	188	189	210	211	232	233	254	270	291	292	313	314	335	336	357
Q9QUH3	13	I		J		B		B		B		B		B		B		B		B		K		L		M
		43	64	65	86	98	119	120	141	142	163	164	185	185	206	218	239
Q9TS49-F	8	C		B		B		B		B		B		B		B
		52	73	73	94	106	127	128	149	150	168	168	189	190	211	212	233	234	255	269	290	291	312	313	334	335	356
Q9UBJ3	13	I		J		B		B		B		B		B		B		B		B		K		L		M
		67	88	89	110	122	143	144	165	166	187	188	208	208	229	241	262
Q9Z2L4	8	C		B		B		B		B		B		B		B
		80	101	102	123	135	156	157	178	179	200	201	222	223	244	245	266	285	306
ape_macfa	9	D		B		B		B		B		G		H		B		B
		72	93	94	115	127	148	149	170	171	192	193	214	215	236	237	258	277	298
ape_mouse	9	D		B		B		B		B		G		H		B		B
		80	101	102	123	135	156	157	178	179	200	201	222	223	244	245	266	285	306
ape_papan	9	D		B		B		B		B		G		H		B		B
		79	100	101	122	134	155	156	177	178	199	200	221	222	243	244	265	284	305
ape_pig	9	D		B		B		B		B		G		H		B		B
		74	95	96	116	128	149	150	171	172	193	194	215	216	237	238	259	278	299
ape_rabit	9	D		B		B		B		B		G		H		B		B
		72	93	94	115	127	148	149	170	171	192	193	214	215	236	237	258	277	298
ape_rat	9	D		B		B		B		B		G		H		B		B

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A	APO repeat - type A
B	APO repeat - type B
C	APO repeat - type C
D	APO repeat - type D
E	APO repeat - type E
F	APO repeat - type F
G	APO repeat - type G
H	APO repeat - type H
I	APO repeat - type I
J	APO repeat - type J
K	APO repeat - type K
L	APO repeat - type L
M	APO repeat - type M
U	APO repeat - type unknown

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