sushi_ref6 - reference 6

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Number of sequences              45

Key:

A	SUSHI repeat - type A
B	SUSHI repeat - type B
C	SUSHI repeat - type C
D	SUSHI repeat - type D
E	SUSHI repeat - type E
F	SUSHI repeat - type F
G	SUSHI repeat - type G
H	SUSHI repeat - type H
U	SUSHI repeat - type unknown

Sequence Name	# Repeats
		20	83	84	144	145	208	209	265	266	323	324	388	388	445	447	508	508	567	568	626	629	687	690	747	752	806	810	867	869	929	930	987	988	1046	1047	1105	1108	1166	1166	1231
CFAH_HUMAN	20	E		B		B		B		B		B		B		B		B		B		B		B		F		B		B		B		B		B		B		G
		29	89	90	151	152	216	217	276	277	343	344	409	410	468
O08569	7	A		B		B		B		B		B		B
		29	88	88	146
APAR_PIG	2	B		B
		49	110	111	172	173	237	238	297	298	365	366	428	428	486	486	544
C4BP_BOVIN	8	A		B		B		B		B		B		B		B
		49	111	112	173	174	237	238	297	298	363	364	425	425	483	483	541
C4BP_HUMAN	8	A		B		B		B		B		B		B		B
		57	118	119	179	180	243	244	302	302	358	358	416
C4BP_MOUSE	6	A		B		B		B		B		B
		14	75	76	137	138	202	203	261	262	327	328	389	389	446	446	504
C4BP_RAT	8	A		B		B		B		B		B		B		B
		19	84	85	146	147	204	205	264
Q07033	4	C		B		B		B
		2	59	60	119
1VVC-pdb-vaccv	2	B		B
		19	84	85	146	147	204	205	264
VCP_VACCV	4	C		B		B		B
		33	94	95	156	157	221	222	281	282	348	349	414	455	512
Q60736	7	A		B		B		B		B		B		B
		19	80	81	142	143	200	201	260
P87616	4	C		B		B		B
		22	85	90	149	153	213	214	274	275	345	350	409	409	469	470	525	526	596	601	660	661	717	718	782	787	846	850	910	911	971
CR2_HUMAN	15	B		B		B		B		B		B		B		D		B		B		D		B		B		B		B
		13	76	81	141	145	205	206	266	267	337	342	401	401	461	462	517	518	588	593	652	653	707	708	772	777	836	840	900	901	961
CR2_MOUSE	15	B		B		B		B		B		B		B		D		B		B		D		B		B		B		B
		22	85	90	149	153	213	214	274	275	345	350	409	409	469	470	525	526	596	601	660	660	720	720	776	777	840	841	900	904	964	965	1025
Q14212	16	B		B		B		B		B		B		B		D		B		B		B		D		B		B		B		B
		31	94	99	159	163	223	224	284	285	355	360	419	419	479	480	535	536	606	611	670	672	728	729	793	798	857	861	921	922	982
O46545	15	B		B		B		B		B		B		B		D		B		B		D		B		B		B		B
		21	81	82	143	144	214	216	275	275	334	335	397	398	461	466	526	530	590	591	651	652	680
Q99254	11	A		B		B		B		B		B		B		B		B		B		B
		22	92	94	153	155	217	218	278	280	340	342	402
O35520-F	6	B		B		B		B		B		B
		37	97	98	159	160	230	232	291	293	355	356	416
Q63612	6	A		B		B		B		B		B
		42	102	103	164	165	235	237	296	296	356	357	419	420	490	492	552	553	614	615	685	687	746	746	806	807	869	870	940	942	1002	1003	1064	1065	1135	1137	1196	1196	1256	1257	1319	1320	1390	1395	1455	1456	1517	1518	1588	1590	1649	1649	1709	1710	1772	1773	1843	1847	1907	1908	1968
CR1_HUMAN	30	A		B		B		B		B		B		B		A		B		B		B		B		B		B		A		B		B		B		B		B		B		A		B		B		B		B		B		B		B		B
		42	102	103	164	165	235	237	296	296	356	357	419	420	490	492	552	553	614	615	685	687	746	746	806	807	869	870	940	942	1002	1003	1064	1065	1135	1137	1196	1196	1256	1257	1319	1320	1390	1392	1452	1453	1514	1515	1585	1587	1646	1646	1706	1707	1769	1770	1840	1845	1905	1906	1967	1968	2038	2040	2099	2099	2159	2160	2222	2223	2293	2297	2357	2358	2418
Q16744	37	A		B		B		B		B		B		B		A		B		B		B		B		B		B		A		B		B		B		B		B		B		A		B		B		B		B		B		B		A		B		B		B		B		B		B		B		B
		84	144	145	206	207	277	279	339	341	401
Q64735	5	A		B		B		B		B
		37	97	98	159	160	230	232	291	293	355	356	416	418	478
Q63135	7	A		B		B		B		B		B		B
		20	83	84	144	145	208	209	265	266	323	324	388	388	445	447	508	508	567	568	625	628	686	689	746	751	805	807	864	866	934	935	992	993	1051	1052	1110	1113	1171	1171	1235
CFAH_MOUSE	20	E		B		B		B		B		B		B		B		B		B		B		B		F		B		B		B		B		B		B		G
		22	86	86	143	146	204	207	265	265	330
CFH1_HUMAN	5	B		B		B		B		G
		22	86	86	144	146	207	210	268	268	332
CFHD_HUMAN	5	B		B		B		B		G
		22	86	86	143	148	206	206	270
CFHE_HUMAN	4	B		B		B		G
		1	53	54	117	118	174	175	232	233	295	295	352	354	415	415	474	475	533	537	595	598	654	659	670
Q28085	12	B		B		B		B		B		B		B		B		B		B		B		F
		27	84	85	149	149	206	208	269	269	328	331	389	389	453
Q61407	7	B		B		B		B		B		B		G
		25	87	88	148	149	209	210	269	270	332	333	392	393	448	449	505	507	565	568	627	627	680	681	741	742	805	806	868	869	932	934	992	992	1054
Q91275	17	U		B		B		B		U		U		B		B		U		B		U		B		U		U		U		B		G
		23	87	87	148	148	207	210	268	268	332
Q92496	5	B		B		B		B		G
		27	91	91	148	150	211	211	270	271	328	331	389	392	449	454	508	510	567	568	625	626	684	687	745	745	809
Q61408	13	B		B		B		B		B		B		B		F		B		B		B		B		G
		22	82	83	140	141	203	204	263	263	328
APOH_HUMAN	5	U		B		B		B		H
		35	92	93	155	156	215	215	280
APOH_RAT	4	B		B		B		H
		32	95	95	160	161	222	223	285
DAF_CAVPO	4	A		A		B		B
		24	90	90	149	152	211	212	270	273	330	335	392	395	453	453	518	523	581	581	649
F13B_HUMAN	10	B		B		B		B		B		B		B		U		B		G
		299	363	364	431
CASP_MESAU	2	U		U
		175	232	233	291	292	349	350	409	410	467	468	527	548	607	608	667	668	725	726	785
P91658	10	B		B		B		B		B		B		U		B		B		B
		353	412	528	589	706	765	767	830	834	895
Q62223	5	B		B		B		B		B
		141	198	198	257	259	324	575	637	684	751
LFC_TACT	5	U		B		B		B		B
		317	379
O01654	1	U
		196	257	258	319
LEM1_HUMAN	2	B		B
		660	719	1039	1098	1099	1170
P90891	3	U		U		U
		815	875
PGCB_BOVIN	1	A
		93	152	155	213
CO2_MOUSE	2	B		B

Key:

A	SUSHI repeat - type A
B	SUSHI repeat - type B
C	SUSHI repeat - type C
D	SUSHI repeat - type D
E	SUSHI repeat - type E
F	SUSHI repeat - type F
G	SUSHI repeat - type G
H	SUSHI repeat - type H
U	SUSHI repeat - type unknown

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