lrr_1_ref6 - reference 6

Multiple alignment of LRR repeats:-

Multiple alignment of LRR-NT repeats:-

Multiple alignment of LRR-CT repeats:-

Number of sequences              9

Key:

LRR	LRR repeat
LRR-NT	LRR-NT repeat
LRR-CT	LRR-CT repeat

Sequence Name	# Repeats
		40	73	75	98	99	122	123	146	147	170	171	194	195	218	219	242	243	266	267	290	291	314	315	338	339	362	363	386	387	410	411	434	435	458	459	482	483	506	507	529	536	584
ALS_HUMAN	21	LRR-NT		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR-CT
		72	99	101	124	125	148	149	172	173	196	197	220	230	279	294	321	323	346	347	370	371	394	395	418	419	442	452	501	518	545	547	570	572	595	596	619	620	643	653	702	714	741	743	766	767	790	791	814	815	838	848	897
SLIT_DROME	26	LRR-NT		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR-CT		LRR-NT		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR-CT		LRR-NT		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR-CT		LRR-NT		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR-CT
		33	60	62	85	86	109	110	133	134	157	158	181	182	205	215	264	279	306	308	331	332	355	356	379	380	403	404	427	437	486	503	530	532	556	557	580	581	604	605	628	629	652	662	711	723	750	752	774	775	798	799	822	823	846	856	905
O75094	28	LRR-NT		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR-CT		LRR-NT		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR-CT		LRR-NT		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR-CT		LRR-NT		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR-CT
		24	53	54	77	78	101	102	125	126	149	150	173	174	197	198	221	222	245	247	270	271	295	302	349
CHAD_BOVIN	12	LRR-NT		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR-CT
		20	48	51	74	75	98	99	122	123	146	147	170	171	194	195	218	219	242	243	266	267	290	291	314	315	339	340	363	364	387	388	411	421	473
GPV_MOUSE	17	LRR-NT		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR-CT
		33	69	151	174	175	197	198	221	222	245	246	269	270	293	294	319	320	342	343	366	367	390	391	414	415	438	439	463	473	496	498	521	523	548	561	619	630	663	644	667	669	692	693	715	715	738	751	800
TOLL_DROME	24	LRR-NT		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR-CT		LRR-NT		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR-CT
		23	55	68	90	91	114	115	138	146	169	170	193	211	233	236	260	260	283	284	307	308	333	334	357	358	381	382	405	406	429	430	453	453	476	477	500	501	524	525	547	548	570	570	592	595	617	617	640	668	691	706	763	785	818	844	867	868	891	891	914	915	938	946	999
Q26388	32	LRR-NT		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR-CT		LRR-NT		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR-CT
		9	32	33	56	57	80	90	139	151	178	180	203	203	226	227	250	251	274	284	333
O95804	10	LRR		LRR		LRR		LRR-CT		LRR-NT		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR-CT
		43	74	102	125	126	149	149	172	173	196	196	219	231	281	348	381	385	408	409	432	433	456	457	480	481	504	504	527	538	588
O94933	15	LRR-NT		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR-CT		LRR-NT		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR		LRR-CT

Key:

LRR	LRR repeat
LRR-NT	LRR-NT repeat
LRR-CT	LRR-CT repeat

Multiple alignment of LRR repeats:-

complete sequences
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repeats only

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