Difference between revisions of "Main Page"
(→Thématiques et Projets) |
|||
| (30 intermediate revisions by 5 users not shown) | |||
| Line 1: | Line 1: | ||
| + | La base de données Mysql de Wikili (wikidb) est hébergée par kilida depuis le 2012/03/12. Raymond | ||
| + | |||
==[[LBGI]]== | ==[[LBGI]]== | ||
| − | Vous êtes ici sur [http://lbgi | + | Vous êtes ici sur [http://lbgi.fr/wikili wikili] le serveur wiki du [[LBGI]] BioInformatique et Génomique Intégratives |
| + | |||
| + | Voir également [http://lbgi.fr/lbgiki lbgiki], le '''wiki privé''' resteint aux membres de l'équipe. | ||
| − | + | LBGI est un acronyme récursif qui signifie '''L'''BGI '''B'''ioinformatique et '''G'''énomique '''I'''ntrégratives | |
==Progiciels== | ==Progiciels== | ||
| Line 9: | Line 13: | ||
* [[Gscope]] en général | * [[Gscope]] en général | ||
** ... et [[Gscope Clonage]] en particulier | ** ... et [[Gscope Clonage]] en particulier | ||
| − | * [[Café des sciences]] | + | * [[Café des sciences]] |
| − | * [http://lbgi | + | * [http://lbgi.fr/lbgiki/index.php/Subversion Subversion], notre outil de versionning |
* obsolete: [[CVS]] Pour récupérer les dernières versions stables de programmes enregistrés sur le dépot. | * obsolete: [[CVS]] Pour récupérer les dernières versions stables de programmes enregistrés sur le dépot. | ||
* [[MACSIMS]] | * [[MACSIMS]] | ||
* [[RReportGenerator]] .. c'est un graphical user interface pour des analyses statistiques avec rapports automatiques pour des applications de routine .. | * [[RReportGenerator]] .. c'est un graphical user interface pour des analyses statistiques avec rapports automatiques pour des applications de routine .. | ||
* [[String]] nos outils pour s'en servir facilement | * [[String]] nos outils pour s'en servir facilement | ||
| + | * [[Vep]] Variant Effect Predictor | ||
| + | * [[Neopipe]] Workflow for protein family analysis. A major update of [[PipeAlign]] | ||
==Serveur et données== | ==Serveur et données== | ||
| Line 24: | Line 30: | ||
==Thématiques et Projets== | ==Thématiques et Projets== | ||
| − | Voir aussi la liste mise à jour dynamiquement des [http://alnitak | + | Voir aussi la liste mise à jour dynamiquement des [http://alnitak.fr/publicLBGI/organisationLBGI.php Thématiques du LBGI] et visiter le site [http://lbgi.fr/dbgs DBGS] |
| + | * [[MicroVesicles]] stage de Anaïs Nicol | ||
* [[Alvinella]] | * [[Alvinella]] | ||
* [[Fed]] Federating data a common achitecture to manage websites such as | * [[Fed]] Federating data a common achitecture to manage websites such as | ||
** [http://genoret.igbmc.fr/genoret/wiki Genoret] | ** [http://genoret.igbmc.fr/genoret/wiki Genoret] | ||
| + | ** [[CSTB]] | ||
** [[DBGS]] | ** [[DBGS]] | ||
** [[Gx]] and its database [[GxDb]] | ** [[Gx]] and its database [[GxDb]] | ||
** [[IdV]] for the Institut de la Vision | ** [[IdV]] for the Institut de la Vision | ||
| + | * [[ImAnno]] a web based annotation tool with a powerfull search engine | ||
* [[GenoretGenes]] | * [[GenoretGenes]] | ||
* [[RetinoBase]] | * [[RetinoBase]] | ||
| Line 38: | Line 47: | ||
==Outils programmation et Unix== | ==Outils programmation et Unix== | ||
| + | * [[ssh]] | ||
* [[Tcl/Tk]] | * [[Tcl/Tk]] | ||
* [[Java]] | * [[Java]] | ||
Latest revision as of 13:19, 22 September 2021
La base de données Mysql de Wikili (wikidb) est hébergée par kilida depuis le 2012/03/12. Raymond
Contents
LBGI
Vous êtes ici sur wikili le serveur wiki du LBGI BioInformatique et Génomique Intégratives
Voir également lbgiki, le wiki privé resteint aux membres de l'équipe.
LBGI est un acronyme récursif qui signifie LBGI Bioinformatique et Génomique Intrégratives
Progiciels
Quel outil utilise quel outil ?
- BIRD Biological Integration and Retrivial Data
- Gscope en général
- ... et Gscope Clonage en particulier
- Café des sciences
- Subversion, notre outil de versionning
- obsolete: CVS Pour récupérer les dernières versions stables de programmes enregistrés sur le dépot.
- MACSIMS
- RReportGenerator .. c'est un graphical user interface pour des analyses statistiques avec rapports automatiques pour des applications de routine ..
- String nos outils pour s'en servir facilement
- Vep Variant Effect Predictor
- Neopipe Workflow for protein family analysis. A major update of PipeAlign
Serveur et données
- Configuration minimale
- Installation PHP
- Où en sont nos serveurs Star, StarV, Surf, Lame1-14 Kilida et Alnitak et Eyear et Moby
- Source de données ... tous nos serveurs et bases de données
- Tout sur UCSCGenomes
Thématiques et Projets
Voir aussi la liste mise à jour dynamiquement des Thématiques du LBGI et visiter le site DBGS
- MicroVesicles stage de Anaïs Nicol
- Alvinella
- Fed Federating data a common achitecture to manage websites such as
- ImAnno a web based annotation tool with a powerfull search engine
- GenoretGenes
- RetinoBase
- CADO4MI
- MAGOS
- JavOO
Outils programmation et Unix
- ssh
- Tcl/Tk
- Java
- aide Unix
- Html et Javascript
- logiciels disponibles sur les serveurs.
- Bibliothèque interne
