Difference between revisions of "BIRD"

Revision as of 14:50, 13 September 2007

Le site web de Hoan

Il se peut qu'il faille encore faire setbird avant de lancer gscope

La suite est à confirmer par un bon vieux oue

les procédures qui font appel au web service :
- proc BirdGetFields {NM field1,field2} rend field1=fff field2=zzz
- proc BirdGet {NM field} rend simplement la valeur du champ

proc Bird {Query {Format ""} {Out ""}} en exec sur nos machines qui ont Java
- [exec bird_explorer_ucsc $FichierQuery $OutFile format=$Format display=yes]

proc BirdSendQueryAndGetFromUrl {Query {Url ""} {Options ""}}
- ::http::geturl http://star4:8080/mybiodb/bsearch -query $QueryEncode $Option
proc BirdSendQueryUrlAndGetFromUrl {QueryUrl {Url ""} {Options ""}}
- ::http::geturl ::http::geturl http://star4:8080/mybiodb/bsearch -query $QueryUrlEncode $Option
proc BirdPostFileAndGetFromUrl {Filename {Url ""} {Options ""}}
- ::http::geturl ::http::geturl http://star4:8080/mybiodb/bsearch -query $PostEncode

@@ Line 1: / Line 1: @@
-Le site web de [http://star4:8080/mybiodb BIRD]
+==BIRD==
+Le [[Bird Website|site web]] de Hoan
+==Gscope utilise BIRD==
+Il se peut qu'il faille encore faire '''setbird''' avant de lancer gscope
+La suite est à confirmer par un bon vieux '''[[oue]]'''
+* les procédures qui font appel au web service :
+** proc '''BirdGetFields''' {NM field1,field2}   rend field1=fff  field2=zzz
+** proc '''BirdGet''' {NM field}                 rend simplement la valeur du champ
+* proc '''Bird''' {Query {Format ""} {Out ""}}   en exec sur nos machines qui ont Java
+** [exec bird_explorer_ucsc $FichierQuery $OutFile format=$Format display=yes]
+* proc '''BirdSendQueryAndGetFromUrl''' {Query {Url ""} {Options ""}}
+** ::http::geturl http://star4:8080/mybiodb/bsearch -query $QueryEncode $Option
+* proc '''BirdSendQueryUrlAndGetFromUrl''' {QueryUrl {Url ""} {Options ""}}
+** ::http::geturl ::http::geturl http://star4:8080/mybiodb/bsearch -query $QueryUrlEncode $Option
+* proc '''BirdPostFileAndGetFromUrl''' {Filename {Url ""} {Options ""}}
+** ::http::geturl ::http::geturl http://star4:8080/mybiodb/bsearch -query $PostEncode