Cluspack

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Cluspack permet de lancer un clustering en k-means ou en mixture-models

Input format: Des données doivent commencer avec une ligne indiquant le nombre des lignes et des colonnes. La première colonne des données peut contenir des identifiants (et toutes autres colonne de texte, annotation etc devront se touver à la fin)

Utilisation: pour utiliser le GUI crée par Adeline et Nicolas setcluspack cluspackX

Il existe aussi une variante de clustering itérative en ligne de commande: (cet exemple lancera 10 fois un clustering kMeans) /biolo/cluspack/cluspacksucc.tcl myDataForClustering.txt kmeans 10

Attention : cluspack marche seulement sur des serveurs "star" et plus sur beaufort !!

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