UniprotData

UniprotData est la base de donnée Uniprot regroupant ici les fiches Embl de tout Swissprot et Trembl

le programme GeneQuid permet l'interrogation rapide.

GeneQuid a fait l'indexation des ID et AC de toutes les fiches, et rend instantannément la ou les fiches ou champs qui lui sont demandés.

GeneQuid lit les 543GO de Uniprot.dat et crée un index (de 14GO) avec pour chaque ID ou AC la position dans ce ficher du début et de la fin de la fiche. Puis il crée une base Sqlite (22GO) avec cet index.

En fonctionnement normal il ne se sert que du fichier Sqlite qui est lui-même indexé.