EleGen

From Wikili

Revision as of 14:14, 20 July 2020 by Ripp (talk | contribs)

(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)

Jump to: navigation, search

EleGen Eléments Génomiques .. Pour Homo sapiens

C'est une procédure de gscope qui marche à merveille !

 EleGen permet d'interrgoger les annotations des ELEments du GENome 
 EleGen Chr01 X ListOf Gn
 EleGen Chr01 X NOTCH2 ListOfD
 EleGen Chr01 X NOTCH2 ListOfF
 EleGen Chr01 X NOTCH2 ListOfId
 EleGen Chr01 X ListOf Id
 EleGen Chr01 X ListOf All
 EleGen Chr01 X exon:57053 D
 EleGen Chr01 6 ListOf Id
              ^ the type can be 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 X

 #rR X=exon 9=FirstExon 8=5UTR 7=3UTR 6=Boundary 5=Promoter 4=Intron 3=1to5kb 2=Enhancer 1=Intergen (voir AnnotType)
 #rR On crée aussi un Final qui contient ces types en mettant en priorité X puis 9 puis 8 ...
 #rR le 9 8 7 sont sytématiquement écrasés par X car ce sont aussi des eXons

utilisable en procédure normale ou

par le Café des sciences

 qds Zero EleGen Chr01 X ListOf Id

ou en web

 http://lbgi.fr/wscoperr?Zero&EleGen&Chr01&X&ListOf&Gn

Retrieved from "http://lbgi.fr/wikili/index.php?title=EleGen&oldid=3078"