Difference between revisions of "OrthoInspector"
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| − | #* Archaea | + | #* ./Archaea ./Bacteria ./Eukaryota ./Qfo ./Transverse ./Virus |
| − | + | #* Ces répertoires correspondent à ce qui est appelé OiDomain dans Gscope | |
| − | + | #* Quand on travaille dans le projet Archaea la proc OiDomain rend Archaea | |
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Revision as of 21:58, 23 January 2018
OrthoInspector
Initialement développé par Benjamin Linard, repris par Yannis Nevers. Je (Raymond) ne parlerai ici que de ce qui concerne Gscope et la gestion des organismes pour les projets Archaea, Bacteria, Eukaryota, Qfo, Transverse et Virus.
La manière de gérer OrthonInspector a vraiment beaucoup changé depuis 2016, Yannis avait fait ses protéomes et je les intégrais au fur et à mesure. Fin 2016 on a lancé les 10 000 000 de blast sur la grille pour les Eucaryotes. Après on a recommencé mais on ne prenant pas tout le monde ... il a fallu nommer les organismes, etc.
Comment ça marche
- Yannis crée les protéomes dans /genomics/link/OrthoInspector_Proteomes/
- ./Archaea ./Bacteria ./Eukaryota ./Qfo ./Transverse ./Virus
- Ces répertoires correspondent à ce qui est appelé OiDomain dans Gscope
- Quand on travaille dans le projet Archaea la proc OiDomain rend Archaea
