Difference between revisions of "UniprotData"
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| − | En fonctionnement normal | + | En fonctionnement normal GeneQuid ne se sert que du fichier Sqlite qui est lui-même indexé ce qui lui permet de rendre instantannément la ou les fiches ou champs qui lui sont demandés, et ce même s'il ne tournait pas lors de l'appel. |
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Revision as of 19:23, 15 July 2020
UniprotData est la base de donnée Uniprot regroupant ici les fiches Embl de tout Swissprot et Trembl
le programme GeneQuid permet l'interrogation rapide.
Lors de la création de la base GeneQuid lit les 543GO de Uniprot.dat et crée un index (de 14GO) avec pour chaque ID ou AC la position dans ce ficher du début et de la fin de la fiche. Puis il crée une base Sqlite (22GO) avec cet index.
En fonctionnement normal GeneQuid ne se sert que du fichier Sqlite qui est lui-même indexé ce qui lui permet de rendre instantannément la ou les fiches ou champs qui lui sont demandés, et ce même s'il ne tournait pas lors de l'appel.
GeneQuid peut s'appeler en ligne de commande, en appel de procédure dans Gscope ou en web
lbgi.fr://wscoperr?GeneQuid&Help
