Thèse de Doctorat Bioinformatique

• Université de Strasbourg
• Sujet : Un système pour l'extraction de connaissances à partir de données biomédicales.
• Directeur de thèse : Dr. Olivier POCH
• Laboratoire de Bioinformatique et de Génomique Intégratives, Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire.
• Boursier du gouvernement vietnamien et boursier du gouvernement français.

Septembre 2006

Diplôme de Master 2 Recherche Informatique "Image Information Hypermédia"

• Université Paul Sabatier - Toulouse - France
• Mention : Assez-bien
• Boursier de formation initiale de l'AUF 2005-2006

Diplôme d'Ingénieur en Informatique

• Université de Cantho - Vietnam
• Mention : Bien
• Certification francophone - Filière universitaire francophone d'Informatique - AUF.
• Mémoire de fin d'études : "Récapitulation des tons de couleur sur une image".
• Domaine : traitement d'images.

• Fouille de données relationnelles à l'aide de la Programmation Logique Inductive (PLI)
• Couplage de l'approche PLI et d'autres algorithmes de fouilles de données comme Support Vector Machine, Réseaux Bayésiens.
• Algorithmes génétiques, systèmes de classifieurs
• Portail web, système de gestion de contenu CMS
• Traitement d'images

• Analyse du lien génotype/phénotype au sein des pathologies humaines.

• Nguyen NH, Luu TD, Poch O, Thompson JD. Knowledge Discovery in variant databases using Inductive Logic Programming. Bioinformatics and Biology Insights. 2012. In press
• Zeitz C, Jacobson SG, Hamel CP, Bujakowska K, Orhan E, Zanlonghi X, Lancelot ME, Michiels C, Schwartz SB, Bocquet B, CSNB consortium, Antonio A, Audier C, Letexier M, Saraiva JP, Luu TD, Sennlaub F, Nguyen H, Poch O, Dollfus H, Lecompte O, Kohl S, Sahel JA, Bhattacharya SS, Audo I. Whole exome sequencing identifies mutations in LRIT3 as a cause for autosomal recessive complete congenital stationary night blindness. Am J Hum Genet.
• Audo I, Bujakowska K, Orhan E, Poloschek CM, Defoort-Dhellemmes S, Drumare I, Kohl S, Luu TD, Lecompte O, Zrenner E, Lancelot ME, Antonio A, Germain A, Michiels C, Audier C, Letexier M, Saraiva JP, Leroy BP, Munier FL, Mohand-Saïd S, Lorenz B, Friedburg C, Preising M, Kellner U, Renner AB, Moskova-Doumanova V, Berger W, Wissinger B, Hamel CP, Schorderet DF, De Baere E, Sharon D, Banin E, Jacobson SG, Bonneau D, Zanlonghi X, Le Meur G, Casteels I, Koenekoop R, Long VW, Meire F, Prescott K, de Ravel T, Simmons I, Nguyen H, Dollfus H, Poch O, Léveillard T, Nguyen-Ba-Charvet K, Sahel JA, Bhattacharya SS, Zeitz C. Whole-exome sequencing identifies mutations in GPR179 leading to autosomal-recessive complete congenital stationary night blindness. Am J Hum Genet 90, 321-330. 2012. doi:10.1016/j.ajhg.2011.12.007.
• Luu TD, Rusu AM, Walter V, Linard B, Poidevin L, Ripp R, Moulinier L, Muller J, Raffelsberger W, Wicker N, Lecompte O, Thompson JD, Poch O, Nguyen NH. KD4v: Comprehensible Knowledge Discovery System For Missense Variant. Nucleic Acids Res. 2012. doi:10.1093/nar/gks474.
• Luu TD, Rusu AM, Walter V, Ripp R, Moulinier L, Muller J, Toursel T, Thompson JD, Poch O, Nguyen NH. MSV3d: database of human MisSense variants mapped to 3D protein structure. Database (Oxford). 2012. bas018. doi: 10.1093/database/bas018.

• Luu TD, Nguyen NH, Friedrich A, Muller J, Moulinier L, Poch O: Extracting Knowledge from a Mutation Database Related to Human Monogenic Disease Using Inductive Logic Programming. In International Conference on Bioscience, Biochemistry and Bioinformatics; Singapore. IEEE Catalog Number: CFP1134M-PRT. ISBN: 978-1-4244-9388-3.
• Luu TD, Nguyen NH, Friedrich A, Muller J, Moulinier L, Poch O: Discovering knowledge hidden in mutation data using Inductive Logic Programming. In Les assises du GdR I3; Strasbourg. 2010.

• Luu TD, Poch O, Nguyen NH. KD4v: Comprehensible Knowledge Discovery System For Missense Variants. In European Conference on Computational Biology; Basel. Septembre 2012.
• Luu TD, Poch O, Nguyen NH. MSV3d: Database of human MisSense Variants mapped to 3D protein structure. In European Conference on Computational Biology ; Basel. Septembre 2012.
• Luu TD, Nguyen NH, Friedrich A, Muller J, Moulinier L, Poch O. SM2PH-kb: Data Warehouse Intelligence for the Integrated Study of Human Structural Mutation to Phenotypes Relationships. In Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques ; Paris. Juin 2011.
• Luu TD, Nguyen NH, Friedrich A, Muller J, Moulinier L, Mandel J, Poch O. A novel tool for the integrated study of human missense variants to phenotypes relationships. In European Human Genetics Conference; Amsterdam. Mai 2011.
• Luu TD, Nguyen NH, Friedrich A, Muller J, Moulinier L, Poch O: Human-comprehensible rule generator for identifying deleterious amino acid variants. In Theoretical Approaches for the Genome and the proteins; Annecy-le-Vieux. 2010. Young Fellowship
• Luu TD, Nguyen NH, Friedrich A, Muller J, Moulinier L, Poch O: Development of knowledge-based system for analysing the effects of single nucleotide polymorphisms on the protein function. In Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques; Montpellier. 2010.
• Luu TD, Nguyen NH, Friedrich A, Muller J, Moulinier L, Poch O: Discovering knowledge hidden in mutation data using Inductive Logic Programming. In Intelligent Systems for Molecular Biology; Boston. 2010.
• Luu TD, Nguyen NH, Friedrich A, Muller J, Moulinier L, Poch O: Discovering knowledge hidden in mutation data using Inductive Logic Programming. In GT-Fouille de Données Complexes; Paris. 2010

Stage Master 2 Recherche

Février 06 - Juillet 06

Directeur de recherche

Juillet 04 - Septembre 04

Responsabilités

Entreprise informatique FPT, Vietnam (www.fpt.vn).

Gestion de projet