seed used = 1113835993 12 999 X02152Hom ATG GCA ACT CTA AAG GAT CAG CTG ATT TAT AAT CTT CTA AAG GAA GAA CAG ACC --- CCC CAG AAT AAG ATT ACA GTT GTT GGG GTT GGT GCT GTT GGC ATG GCC TGT GCC ATC AGT ATC TTA ATG AAG GAC TTG GCA GAT GAA CTT GCT CTT GTT GAT GTC ATC GAA GAC AAA TTG AAG GGA GAG ATG ATG GAT CTC CAA CAT GGC AGC CTT TTC CTT AGA ACA CCA AAG ATT GTC TCT GGC AAA GAC TAT AAT GTA ACT GCA AAC TCC AAG CTG GTC ATT ATC ACG GCT GGG GCA CGT CAG CAA GAG GGA GAA AGC CGT CTT AAT TTG GTC CAG CGT AAC GTG AAC ATA TTT AAA TTC ATC ATT CCT AAT GTT GTA AAA TAC AGC CCG AAC TGC AAG TTG CTT ATT GTT TCA AAT CCA GTG GAT ATC TTG ACC TAC GTG GCT TGG AAG ATA AGT GGT TTT CCC AAA AAC CGT GTT ATT GGA AGT GGT TGC AAT CTG GAT TCA GCC CGA TTC CGT TAC CTG ATG GGG GAA AGG CTG GGA GTT CAC CCA TTA AGC TGT CAT GGG TGG GTC CTT GGG GAA CAT GGA GAT TCC AGT GTG CCT GTA TGG AGT GGA ATG AAT GTT GCT GGT GTC TCT CTG AAG ACT CTG CAC CCA GAT TTA GGG ACT GAT AAA GAT AAG GAA CAG TGG AAA GAG GTT CAC AAG CAG GTG GTT GAG AGT GCT TAT GAG GTG ATC AAA CTC AAA GGC TAC ACA TCC TGG GCT ATT GGA CTC TCT GTA GCA GAT TTG GCA GAG AGT ATA ATG AAG AAT CTT AGG CGG GTG CAC CCA GTT TCC ACC ATG ATT AAG GGT CTT TAC GGA ATA AAG GAT GAT GTC TTC CTT AGT GTT CCT TGC ATT TTG GGA CAG AAT GGA ATC TCA GAC CTT GTG AAG GTG ACT CTG ACT TCT GAG GAA GAG GCC CGT TTG AAG AAG AGT GCA GAT ACA CTT TGG GGG ATC CAA AAG GAG CTG CAA TTT U07178Sus ATG GCA ACT CTC AAG GAT CAG CTG ATT CAC AAT CTT CTT AAG GAA GAG CAT GTT --- CCC CAC AAT AAG ATT ACA GTT GTT GGG GTT GGT GCT GTT GGC ATG GCT TGT GCC ATC AGT ATC TTA ATG AAG GAA TTG GCG GAT GAA ATT GCT CTC GTT GAT GTC ATG GAA GAC AAA CTG AAG GGA GAG ATG ATG GAT CTG CAA CAT GGC AGC CTT TTC CTT AGG ACC CCA AAA ATT GTC TCT GGC AAA GAC TAT AAC GTG ACT GCA AAC TCT AGG CTG GTT GTT ATC ACA GCT GGT GCA CGT CAG CAA GAG GGA GAA AGC CGT CTT AAT TTG GTC CAG CGT AAT GTG AAC ATC TTT AAA TTC ATC ATT CCT AAT ATT GTA AAA TAC AGC CCA AAC TGC AAG TTG CTT GTT GTT TCC AAT CCA GTG GAT ATC TTG ACC TAT GTG GCT TGG AAG ATA AGT GGC TTT CCC AAA AAC CGT GTT ATT GGA AGT GGT TGC AAT TTG GAT TCA GCC CGG TTC CGT TAC CTA ATG GGG GAA AGG CTG GGA GTT CAC CCC CTA AGC TGT CAT GGG TGG ATC CTT GGG GAG CAT GGA GAC TCT AGT GTG CCT GTG TGG AGC GGA GTA AAT GTT GCT GGT GTC TCC CTG AAG AAT CTG CAC CCT GAA TTA GGC ACT GAT GCA GAT AAG GAA CAC TGG AAA GCG GTT CAC AAA CAG GTG GTG GAC AGT GCT TAT GAG GTG ATC AAA CTG AAA GGC TAC ACG TCC TGG GCC ATT GGA CTA TCT GTT GCA GAT CTG GCA GAA AGT ATA ATG AAG AAT CTT AGG CGG GTG CAT CCG ATT TCC ACC ATG ATT AAG GGT CTC TAT GGG ATA AAA GAG GAT GTC TTC CTT AGT GTT CCT TGC ATC TTG GGA CAG AAT GGA ATC TCA GAT GTT GTG AAA GTG ACT CTG ACT CCT GAG GAA GAG GCT CAT TTG AAG AAG AGT GCA GAT ACA CTT TGG GGG ATC CAG AAA GAG CTG CAA TTT NM017025Rat ATG GCA GCC CTC AAG GAC CAG CTG ATT GTG AAT CTT CTT AAG GAA GAA CAG GTC --- CCC CAG AAC AAG ATT ACA GTT GTT GGG GTT GGT GCT GTT GGC ATG GCT TGT GCC ATC AGT ATC TTA ATG AAG GAC TTG GCT GAT GAG CTT GCC CTT GTT GAT GTC ATA GAA GAT AAG CTA AAG GGA GAG ATG ATG GAT CTT CAG CAT GGC AGC CTT TTC CTT AAG ACA CCA AAA ATT GTC TCC AGC AAA GAT TAT AGT GTG ACT GCA AAC TCC AAG CTG GTC ATT ATC ACC GCG GGG GCC CGT CAG CAA GAG GGA GAG AGC CGG CTC AAT TTG GTC CAG CGA AAC GTG AAC ATC TTC AAG TTC ATC ATT CCA AAT GTT GTG AAA TAC AGT CCA CAG TGC AAA CTG CTC ATC GTC TCA AAC CCA GTG GAT ATC TTG ACC TAC GTG GCT TGG AAG ATC AGC GGC TTC CCC AAA AAC AGA GTT ATT GGA AGT GGT TGC AAT CTG GAT TCG GCT CGG TTC CGT TAC CTG ATG GGA GAA AGG CTG GGA GTT CAT CCA CTG AGC TGT CAC GGG TGG GTC CTG GGA GAG CAT GGC GAC TCC AGT GTG CCT GTG TGG AGT GGT GTG AAC GTC GCC GGC GTC TCC CTG AAG TCT CTG AAC CCG CAG CTG GGC ACG GAT GCA GAC AAG GAG CAG TGG AAG GAT GTG CAC AAG CAG GTG GTT GAC AGT GCA TAC GAA GTG ATC AAG CTG AAA GGT TAC ACA TCC TGG GCC ATT GGC CTC TCC GTG GCA GAC TTG GCC GAG AGC ATA ATG AAG AAC CTT AGG CGG GTG CAT CCC ATT TCC ACC ATG ATT AAG GGT CTC TAT GGA ATC AAG GAG GAT GTC TTC CTC AGC GTC CCA TGT ATC CTG GGA CAA AAT GGA ATC TCA GAT GTT GTG AAG GTG ACA CTG ACT CCT GAC GAG GAG GCC CGC CTG AAG AAG AGT GCA GAT ACC CTC TGG GGA ATC CAG AAG GAG CTG CAG TTC U13687Mus ATG GCA ACC CTC AAG GAC CAG CTG ATT GTG AAT CTT CTT AAG GAA GAG CAG GCT --- CCC CAG AAC AAG ATT ACA GTT GTT GGG GTT GGT GCT GTT GGC ATG GCT TGT GCC ATC AGT ATC TTA ATG AAG GAC TTG GCG GAT GAG CTT GCC CTT GTT GAC GTC ATG GAA GAC AAA CTC AAG GGC GAG ATG ATG GAT CTC CAG CAT GGC AGC CTC TTC CTT AAA ACA CCA AAA ATT GTC TCC AGC AAA GAC TAC TGT GTA ACT GCG AAC TCC AAG CTG GTC ATT ATC ACC GCG GGG GCC CGT CAG CAA GAG GGG GAG AGC CGG CTC AAC CTG GTC CAG CGA AAC GTG AAC ATC TTC AAG TTC ATC ATT CCC AAC ATT GTC AAG TAC AGT CCA CAC TGC AAG CTG CTG ATC GTC TCC AAT CCA GTG GAT ATC TTG ACC TAC GTG GCT TGG AAA ATC AGT GGC TTT CCC AAA AAC CGA GTA ATT GGA AGT GGT TGC AAT CTG GAT TCA GCG CGG TTC CGT TAC CTG ATG GGA GAG AGG CTG GGG GTT CAC GCG CTG AGC TGT CAC GGC TGG GTC CTG GGA GAA CAT GGC GAC TCC AGT GTG CCT GTG TGG AGT GGT GTG AAT GTT GCC GGC GTC TCC CTG AAG TCT CTT AAC CCA GAA CTG GGC ACT GAC GCA GAC AAG GAG CAG TGG AAG GAG GTT CAC AAG CAG GTG GTG GAC AGT GCC TAC GAG GTG ATC AAG CTG AAA GGT TAC ACA TCC TGG GCC ATT GGC CTC TCT GTG GCA GAC TTG GCT GAG AGC ATA ATG AAG AAC CTT AGG CGG GTG CAT CCC ATT TCC ACC ATG ATT AAG GGT CTC TAT GGA ATC AAT GAG GAT GTC TTC CTC AGT GTC CCA TGT ATC CTG GGA CAA AAT GGA ATC TCG GAT GTT GTG AAG GTG ACA CTG ACT CCT GAG GAA GAG GCC CGC CTG AAG AAG AGC GCA GAC ACC CTC TGG GGA ATC CAG AAG GAG CTG CAG TTC M22585rab ATG GCA GCT CTC AAG GAT CAG CTG ATT CAC AAC CTT CTG AAG GAA GAA CAT GTC --- CCC CAA AAT AAG ATC ACG GTT GTG GGG GTT GGT GCT GTG GGC ATG GCC TGT GCC ATC AGT ATC TTA ATG AAG GAC TTG GCG GAT GAA CTT GCT CTT GTT GAT GTC ATG GAA GAT AAA CTG AAG GGA GAG ATG ATG GAT CTC CAG CAT GGC AGC CTT TTC CTT AGA ACC CCC AAA ATT GTC TCT GGC AAG GAC TAC AGT GTG ACG GCC AAC TCC AAG CTG GTG ATC ATC ACG GCT GGG GCA CGG CAG CAA GAG GGA GAA AGC CGT CTG AAC TTG GTC CAG CGT AAC GTG AAC ATC TTC AAA TTC ATC ATT CCC AAT GTT GTC AAG TAC AGC CCC CAC TGC AAG TTG CTT GTT GTT TCC AAT CCA GTG GAT ATC CTG ACC TAT GTG GCC TGG AAG ATA AGT GGC TTT CCC AAA AAC CGT GTG ATT GGA AGT GGT TGC AAC CTG GAT TCA GCC CGC TTC CGT TAC CTG ATG GGG GAA AGG CTG GGA GTT CAC GCG CTG AGC TGT CAC GGC TGG ATC CTG GGC GAG CAT GGA GAT TCA AGT GTG CCT GTG TGG AGC GGC ATG AAC GTT GCT GGT GTC TCC CTG AAG ACT CTG CAC CCA GAG TTA GGC ACC GAT GCA GAC AAG GAA CAG TGG AAA CAA GTG CAC AAA CAA GTG GTA GAC AGT GCT TAT GAG GTG ATC AAG CTG AAG GGC TAC ACT ACC TGG GCC ATT GGA CTG TCT GTG GCA GAT CTG GCA GAG AGC ATA ATG AAG AAT CTC AGG AGG GTG CAT CCG ATT TCC ACC ATG CTT AAG GGG CTC TAT GGA ATA AAG GAG GAT GTC TTC CTT AGT GTT CCT TGC GTC TTG GGA CAA AAT GGG ATC TCA GAC GTT GTG AAG GTG ACT CTA ACC TCT GAA GAA GAG GCC CAC CTG AAG AAG AGC GCG GAC ACG CTG TGG GGA ATC CAA AAA GAG CTG CAG TTT AF070995C ATG TCC ACC GTC AAG GAG CAG CTA ATT CAG AAC CTA ACT CAA GAA GAT AAA ACC --- TCC CGG TGT AAG ATC ACT GTG GTG GGA GTT GGG AAT GTC GGC ATG GCG TGT GCT ATT AGT ATC TTA CTG AAG GAT TTG GCC GAT GAA CTG GCC CTT GTT GAC ACT GAT ACC GAC AAA CTG AAG GGA GAG ACG CTG GAT CTT CTG CAT GGC AGT CTT TTC TTC AAC ACT TCA AAG ATT GTC TCT GGA AAA GAT TAC AGT GTG TCT GCC AAC TCC AAA TTA GTT ATC ATC ACA GCC GGT GCT AGG CAG AAG GTG GGG GAA ACA CGC CTT GAC CTG GTC CAG CGT AAC GTT GCT ATC ATG AAA TCC ATC GTT CCT GGC TTA GTG CAA CAT AGT CCT GAC TGT AAA ATG CTG ATC GTC TCA AAC CCA GTG GAT ATT TTG ACT TAT GTG GTC TGG AAG ATA AGT GGC CTG CCT GCA ACT CGT GTA ATT GGA AGT GGC TGT AAC CTA GAT TCT GCC CGT TTC CGT TAC TTG ATT GGA GAG AAG TTG GGT GTC CAC CCT ACA AGT TGC CAC GGC TGG GTT CTT GGA GAA CAC GGT GAC TCT AGT GTG CCC TTA TGG AGT GGT GTG AAC GTT GCT GGC GTA CTT CTG AAG TCA CTG AAC CCA GCG TTA GGA AGC GAC TCA GAC CAA GAG CAC TGG AAA AAG ATC CAC AAC CAA GTG GTG GAG AGT GGC TAT GAG GTC CTC CGG CTG AAG GGC TAT ACA TCT TGG GCT ATT GGG CTG TCC GTG ACA GAT CTG GCA AGA TCA ATC CTG AAG AAT CTT AGG AGG GTG CAT CCC GTT TCC ACA CTG GTT AAG GGC TTA TAT GAG ATA AAG GAA GAA ATC TTT CTC AGC ATT CCT TGT ATC TTG GGA CAA AAC GGC ATC ACA GAC ATT GTG AAA GTG AAC CTG AAT CCC GAG GAG GAG GCC CTT CTC AGG AAG AGT GCG GAA ACA CTC TGG AAC GTC CAA AAG GAC CTC AAA TTG U95378Sus ATG TCA ACT GTC AAG GAG CAG CTT ATT GAG AAT CTA ATT GAA GAA GAT GAA GTC --- TCC CAG AGT AAG ATC ACC ATT GTT GGA ACC GGT GCT GTA GGC ATG GCT TGT GCT ATT TGT ATC TTA TTG AAG GAT TTG GCT GAT GAG CTT GCC CTT GTT GAT GTT GCA GTG GAC AAA CTG AAG GGA GAA ACA ATG GAT CTT CAG CAT GGC AGT CTT TTC TTC AAT ACT TCA AAG ATT GTC TCT GGA AAA GAT TAC AGT GTA TCT GCA AAC TCC AAA ATT GTT ATT GTC ACA GCA GGT GCA CGG CAG CAG GAG GGA GAA AGT CGC CTT GCC CTG GTC CAG CGT AAT GTG AAT ATC ATG AAA TCA ATC ATT CCT ACC ATA GTC CAA CAT AGT CCT GAC TGT AAG ATG CTT ATT GTT TCA AAT CCG GTG GAT ATT TTG ACC TAC GTT GCT TGG AAG TTA AGT GGC TTA CCT GCA ACT CGT GTA ATT GGA AGT GGT TGT AAT CTA GAC TCT GCC CGT TTC CGT TAC CTA ATT GGA AAG AAA TTG GGT GTA CAT CCC ACA AGC TGT CAT GGT TGG ATT ATT GGA GAA CAT GGT GAC TCT AGT GTG CCT TTA TGG AGT GGA GTA AAT GTT GCT GGT GTT GCT CTG AAG ACT CTT GAT CCT AAG TTA GGA ACT GAT TCA GAC AAG GAC CAG TGG AAA AAT ATC CAT AAA CAA GTT ATT GGA AGT GCC TAT GAG ATT ATC AAG CTG AAG GGG TAT ACC TCT TGG GCT ATT GGA CTG TCT GTG ACA GAT CTG GTA GGA TCA ATT TTG AAA AAT CTT AGG AGA GTG CAT CCA GTT TCT ACT ATG GTT AAG GGC TTA TAC GGA ATA AAA GAA GAA ATC TTT CTC AGC ATC CCT TGT GTC TTG GGG CGA AAT GGT GTC TCA GAT ATT GTG AAA GTT AAC TTG AAT GCT GAG GAG GAG GCC CTT TTC AAG AAG AGT GCA AAC ACG CTT TGG AAT GTC CAA AAA GAC TTG ACG TTT X04752Mus ATG TCC ACC GTC AAG GAG CAG CTG ATT CAG AAC CTA GTT CCG GAA GAT AAA CTT --- TCC CGG TGT AAG ATT ACT GTG GTC GGA GTT GGA AAT GTG GGC ATG GCG TGT GCT ATT AGT ATT TTA CTG AAG GGT TTG GCT GAT GAA CTT GCC CTT GTT GAC GCT GAT ACG AAC AAA CTG AGG GGA GAG GCA CTG GAT CTT CTG CAC GGC AGT CTT TTC CTT AGC ACT CCA AAA ATC GTC TTT GGA AAA GAT TAC AAT GTA TCT GCC AAC TCC AAA CTG GTT ATT ATC ACA GCT GGT GCA AGA ATG GTG TCT GGA GAA ACT CGC CTT GAC CTG CTC CAA CGT AAT GTC GCT ATC ATG AAA GCC ATT GTT CCG GGC ATT GTC CAA AAC AGT CCG GAC TGT AAA ATA ATT ATC GTC ACT AAC CCA GTG GAT ATT TTG ACA TAC GTG GTT TGG AAG ATA AGC GGC TTC CCT GTA GGC CGT GTG ATC GGA AGT GGC TGT AAC CTA GAC TCA GCA CGT TTT CGT TAC CTG ATT GGG GAG AAG CTG GGT GTC AAC CCT ACA AGC TGC CAC GGC TGG GTT CTT GGA GAA CAT GGG GAC TCC AGT GTG CCC ATA TGG AGT GGT GTA AAC GTT GCT GGC GTA ACT CTG AAG TCA CTG AAC CCA GCA ATA GGA ACT GAC TCA GAT AAG GAA CAC TGG AAA AAT GTT CAC AAG CAG GTG GTG GAA GGC GGC TAT GAG GTC CTT AAC ATG AAG GGC TAT ACC TCT TGG GCT ATC GGG CTG TCT GTG ACT GAT CTG GCG CGA TCC ATC TTG AAG AAT CTT AAG AGA GTG CAT CCT GTT ACC ACG CTG GTT AAG GGC TTC CAT GGG ATA AAG GAA GAG GTC TTC CTC AGT ATC CCT TGT GTC TTG GGA CAA AGT GGT ATC ACA GAC TTT GTG AAA GTC AAC ATG ACC GCT GAG GAG GAG GGT CTC CTC AAG AAG AGT GCG GAC ACA CTC TGG AAT ATG CAG AAG GAT CTG CAG TTA U07177Rat ATG TCC ACT GTC AAG GAG CAG CTA ATT CAG AAC CTA GCT CCA GAT GAA AAA CAA --- TCC CGG TGT AAG ATC ACT GTG GTC GGA GTT GGA AAT GTG GGC ATG GCG TGT GCC ATT AGT ATT TTA CTG AAG GGT CTG GCT GAT GAA CTT GCC CTT GTT GAT GCT GAT GAG AAC AAA CTG AAG GGA GAG GCA CTG GAT CTT CTG CAT GGC AGC CTT TTC CTC AGC ACT CCA AAA ATC GTC TTT GGA AAA GAT TAC AGT GTA TCT GCC AAC TCC AAA CTG GTT ATT ATC ACT GCT GGT GCA AGA ATG GTG AGT GGA GAA TCT CGT CTT GCC CTG CTC CAA CGT AAT GTC ACA TCT ATG AAA GCC ATC GTT CCC GGC GTA ATC CAA AAC AGT CCG GAC TGT AAA ATA ATG ATT GTC ACA AAC CCA GTC GAT ATT TTG ACA TAC GTG GTT TGG AAG ATA AGT GGC CTC CCT GTA AGC AGT GTG ATT GGA AGT GGC TGT AAC CTA GAC TCC GCT CGT TTC CGT TAC CTG ATT GGA GAG AAG CTG GGT GTC AAC CCT TCG AGC TGC CAT GGC TGG GTT CTT GGA GAA CAT GGG GAC TCC AGT GTG CCC ATA TGG AGT GGT GTG AAC ATT GCT GGC GTA ACT CTG AAG TCA CTG AAC CCA GCA ATA GGA TCC GAC TCC GAT AAG GAA CAG TGG AAA ACC GTT CAC AAG CAG GTG GTG GAT GGT GGC TAT GAG GTC CTT AAC CTG AAG GGC TAT ACC TCT TGG GCC ATT GCG CTG TCT GTG ACT GAT ATC GCT GCA TCA ATC TTG AAG AAT CTT AAG AGG GTG CAT GCT GTT ACT ACG CTG GTT AAG GGC TTA TAT GGG ATA AAG GAA GAA ATC TTC CTC AGT ATC CCG TGT GTC TTG GGA CAA AGT GGC ATC ACA GAC CTT GTG AAA GTC AAC ATG AAC ACC GAG GAG GAA GCT CTT TTT AAG AAG AGT TGC GAC ATA CTC TGG AAC ATC CAG AAA GAT CTG CAA TTA U13680Hom ATG TCA ACT GTC AAG GAG CAG CTA ATT GAG AAG CTA ATT GAG GAT GAT GAA AAC --- TCC CAG TGT AAA ATT ACT ATT GTT GGA ACT GGT GCC GTA GGC ATG GCT TGT GCT ATT AGT ATC TTA CTG AAG GAT TTG GCT GAT GAA CTT GCC CTT GTT GAT GTT GCA TTG GAC AAA CTG AAG GGA GAA ATG ATG GAT CTT CAG CAT GGC AGT CTT TTC TTT AGT ACT TCA AAG ATT ACT TCT GGA AAA GAT TAC AGT GTA TCT GCA AAC TCC AGA ATA GTT ATT GTC ACA GCA GGT GCA AGG CAG CAG GAG GGA GAA ACT CGC CTT GCC CTG GTC CAA CGT AAT GTG GCT ATA ATG AAA TCA ATC ATT CCT GCC ATA GTC CAT TAT AGT CCT GAT TGT AAA ATT CTT GTT GTT TCA AAT CCA GTG GAT ATT TTG ACA TAT ATA GTC TGG AAG ATA AGT GGC TTA CCT GTA ACT CGT GTA ATT GGA AGT GGT TGT AAT CTA GAC TCT GCC CGT TTC CGT TAC CTA ATT GGA GAA AAG TTG GGT GTC CAC CCC ACA AGC TGC CAT GGT TGG ATT ATT GGA GAA CAT GGT GAT TCT AGT GTG CCC TTA TGG AGT GGG GTG AAT GTT GCT GGT GTT GCT CTG AAG ACT CTG GAC CCT AAA TTA GGA ACG GAT TCA GAT AAG GAA CAC TGG AAA AAT ATC CAT AAA CAA GTT ATT CAA AGT GCC TAT GAA ATT ATC AAG CTG AAG GGG TAT ACC TCT TGG GCT ATT GGA CTG TCT GTG ATG GAT CTG GTA GGA TCC ATT TTG AAA AAT CTT AGG AGA GTG CAC CCA GTT TCC ACC ATG GTT AAG GGA TTA TAT GGA ATA AAA GAA GAA CTC TTT CTC AGT ATC CCT TGT GTC TTG GGG CGG AAT GGT GTC TCA GAT GTT GTG AAA ATT AAC TTG AAT TCT GAG GAG GAG GCC CTT TTC AAG AAG AGT GCA GAA ACA CTT TGG AAT ATT CAA AAG GAT CTA ATA TTT X53828OG1 ATG TCT --- CTC AAG GAT CAT CTC ATC CAC AAT GTC CAC AAA GAG GAG CAC GCT CAT GCC CAC AAC AAG ATC AGC GTG GTT GGT GTG GGT GCA GTT GGA ATG GCT TGT GCC ATC AGC ATC CTG ATG AAG GAC TTG GCA GAT GAA CTT ACC CTT GTT GAT GTT GTG GAG GAC AAG CTG AAA GGA GAA ATG CTT GAT CTC CAG CAT GGC AGC CTC TTC CTC AAA ACA CCA AAG ATT ATA TCT GGC AAA GAT TAC AGC GTG ACT GCA CAC TCC AAG CTG GTC ATT GTC ACT GCT GGT GCC CGT CAG CAA GAA GGA GAA AGC CGT CTT AAC TTG GTC CAA CGC AAT GTC AAT ATC TTC AAA TTC ATC ATT CCC AAT GTT GTG AAA TAC AGT CCT GAC TGC AAG CTG CTG ATT GTC TCA AAC CCA GTG GAT ATT TTG ACC TAT GTG GCC TGG AAG ATC AGT GGC TTT CCT AAA CAC CGT GTT ATC GGT AGT GGC TGC AAT CTG GAC TCA GCC CGT TTC CGC CAC CTC ATG GGA GAA AGA CTG GGC ATC CAT CCT CTG AGC TGC CAT GGG TGG ATT GTT GGA GAG CAT GGA GAC TCC AGT GTG CCT GTC TGG AGC GGA GTG AAT GTT GCT GGT GTC TCC CTG AAG GCT CTT CAT CCA GAC ATG GGA ACT GAT GCA GAC AAG GAG CAC TGG AAG GAG GTT CAC AAG CAG GTG GTG GAC AGT GCC TAT GAG GTC ATC AAA CTG AAG GGT TAC ACA TCA TGG GCT ATT GGC CTT TCT GTG GCA GAT CTA GCT GAA ACT ATC ATG AAG AAC TTA AGA AGA GTG CAC CCA ATC TCT ACA GCT GTT AAG GGC ATG CAC GGA ATA AAA GAT GAT GTC TTC CTA AGT GTT CCT TGT GTA CTG GGC AGC AGT GGC ATC ACT GAT GTA GTG AAG ATG ATC CTA AAA CCT GAT GAA GAG GAG AAA ATA AAG AAG AGC GCA GAT ACA CTC TGG GGA ATT CAG AAA GAA CTA CAG TTT U28410OG2 ATG TCT --- CTC AAG GAG AAG CTG ATC GTA AAT GTT CAC AAA GAA GAG CAG CCC CAT GCC CAC AAC AAG ATC ACT GTG GTT GGG GTT GGT GCA GTT GGC ATG GCT TGT GCC ATA AGT ATT TTG ATG AAG GAC TTG GCT GAT GAA CTT GCC CTT GTT GAT GTC ATA GAG GAC AAG CTG AAA GGG GAA ATG CTG GAC CTC CAG CAT GGA AGC CTC TTT CTC AGG ACA CCA AAG ATT GTT TCT GGC AAA GAC TAT GCT GTG ACT GCA CAC TCC AAG CTG GTC ATC ATC ACT GCT GGA GCA CGC CAG CAA GAA GGT GAA TCT CGC CTC AAC TTG GTT CAG CGC AAT GTG AAC ATC TTC AAA TTC ATC ATT CCT AAT GTT GTC AAG TAC AGT CCC GAC TGC AAG CTG CTT GTT GTT TCC AAT CCA GTG GAT ATT CTG ACC TAC GTG GCA TGG AAG ATC AGT GGC TTT CCT AAG CAC CGT GTT ATT GGA AGT GGT TGC AAT CTG GAC TCT GCC CGT TTC CGC CAC CTG ATG GCT GAA AAG TTG GGG ATC CAC CCT CTC AGC TGC CAT GGC TGG ATT GTT GGG GAG CAT GGA GAC TCC AGC GTG CCT GTC TGG AGT GGT GTG AAT GTT GCT GGC GTC TCT CTG AAA GGC TTA CAT CCT GAC ATG GGG ACT GAT GGT GAC AAG GAG AAC TGG AAA CAG GTC CAC AAG CAA GTG GTA GAC AGT GCT TAT GAG GTT ATC AAG CTG AAG GGG TAC ACA TCC TGG GCA ATT GGT CTC TCT GTG GCT GAT CTA GCT GAA ACC ATC ATG AAA AAT TTA CGA AGA GTA CAT CCA GTT TCT ACA ATG GTA AAG GGC ATG CAC GGA ATT AAC GAT GAT GTC TTC CTG AGT GTT CCT TGT GTC CTG GGC TAC TCA GGA ATT ACA GAT GTT GTG AAA ATG ACT CTG AAG AGT GAG GAG GAA GAT AAA TTG AGG AAG AGT GCA GAT ACA CTC TGG GGA ATC CAG AAG GAG CTT CAG TTT Printing out site pattern counts 12 963 P X02152Hom ATG GCA ACT CTA AAG GAT CAG CTG ATT TAT AAT CTT CTA AAG GAA GAA CAG ACC --- CCC CAG AAT AAG ATT ACA GTT GTT GGG GTT GGT GCT GTT GGC GCC TGT GCC ATC AGT ATC TTA ATG GAC TTG GCA GAT GAA CTT GCT CTT GTT GAT GTC ATC GAA GAC AAA TTG AAG GGA GAG ATG ATG GAT CTC CAA CAT GGC AGC CTT TTC CTT AGA ACA CCA AAG ATT GTC TCT GGC AAA GAC TAT AAT GTA ACT GCA AAC TCC AAG CTG GTC ATT ATC ACG GCT GGG GCA CGT CAG CAA GAG GGA GAA AGC CGT CTT AAT TTG GTC CAG CGT AAC GTG AAC ATA TTT AAA TTC ATC ATT CCT AAT GTT GTA AAA TAC AGC CCG AAC TGC AAG TTG CTT ATT GTT TCA AAT CCA GTG ATC TTG ACC TAC GTG GCT TGG AAG ATA AGT GGT TTT CCC AAA AAC CGT GTT ATT GGA AGT GGT AAT CTG GAT TCA GCC CGA TTC CGT TAC CTG ATG GGG GAA AGG CTG GGA GTT CAC CCA TTA AGC TGT CAT GGG GTC CTT GGG GAA CAT GGA GAT TCC AGT GTG CCT GTA AGT GGA ATG AAT GTT GCT GGT GTC TCT CTG AAG ACT CTG CAC CCA GAT TTA GGG ACT GAT AAA GAT AAG GAA CAG AAA GAG GTT CAC AAG CAG GTG GTT GAG AGT GCT TAT GAG GTG ATC AAA CTC AAA GGC TAC ACA TCC GCT ATT GGA CTC TCT GTA GCA GAT TTG GCA GAG AGT ATA ATG AAG AAT CTT AGG CGG GTG CAC CCA GTT TCC ACC ATG ATT GGT CTT TAC GGA ATA AAG GAT GAT GTC TTC CTT AGT GTT CCT TGC ATT TTG GGA CAG AAT GGA ATC TCA GAC CTT AAG GTG ACT CTG ACT TCT GAG GAA GAG GCC CGT TTG AAG AGT GCA GAT ACA CTT GGG ATC CAA AAG GAG CTG CAA TTT U07178Sus ATG GCA ACT CTC AAG GAT CAG CTG ATT CAC AAT CTT CTT AAG GAA GAG CAT GTT --- CCC CAC AAT AAG ATT ACA GTT GTT GGG GTT GGT GCT GTT GGC GCT TGT GCC ATC AGT ATC TTA ATG GAA TTG GCG GAT GAA ATT GCT CTC GTT GAT GTC ATG GAA GAC AAA CTG AAG GGA GAG ATG ATG GAT CTG CAA CAT GGC AGC CTT TTC CTT AGG ACC CCA AAA ATT GTC TCT GGC AAA GAC TAT AAC GTG ACT GCA AAC TCT AGG CTG GTT GTT ATC ACA GCT GGT GCA CGT CAG CAA GAG GGA GAA AGC CGT CTT AAT TTG GTC CAG CGT AAT GTG AAC ATC TTT AAA TTC ATC ATT CCT AAT ATT GTA AAA TAC AGC CCA AAC TGC AAG TTG CTT GTT GTT TCC AAT CCA GTG ATC TTG ACC TAT GTG GCT TGG AAG ATA AGT GGC TTT CCC AAA AAC CGT GTT ATT GGA AGT GGT AAT TTG GAT TCA GCC CGG TTC CGT TAC CTA ATG GGG GAA AGG CTG GGA GTT CAC CCC CTA AGC TGT CAT GGG ATC CTT GGG GAG CAT GGA GAC TCT AGT GTG CCT GTG AGC GGA GTA AAT GTT GCT GGT GTC TCC CTG AAG AAT CTG CAC CCT GAA TTA GGC ACT GAT GCA GAT AAG GAA CAC AAA GCG GTT CAC AAA CAG GTG GTG GAC AGT GCT TAT GAG GTG ATC AAA CTG AAA GGC TAC ACG TCC GCC ATT GGA CTA TCT GTT GCA GAT CTG GCA GAA AGT ATA ATG AAG AAT CTT AGG CGG GTG CAT CCG ATT TCC ACC ATG ATT GGT CTC TAT GGG ATA AAA GAG GAT GTC TTC CTT AGT GTT CCT TGC ATC TTG GGA CAG AAT GGA ATC TCA GAT GTT AAA GTG ACT CTG ACT CCT GAG GAA GAG GCT CAT TTG AAG AGT GCA GAT ACA CTT GGG ATC CAG AAA GAG CTG CAA TTT NM017025Rat ATG GCA GCC CTC AAG GAC CAG CTG ATT GTG AAT CTT CTT AAG GAA GAA CAG GTC --- CCC CAG AAC AAG ATT ACA GTT GTT GGG GTT GGT GCT GTT GGC GCT TGT GCC ATC AGT ATC TTA ATG GAC TTG GCT GAT GAG CTT GCC CTT GTT GAT GTC ATA GAA GAT AAG CTA AAG GGA GAG ATG ATG GAT CTT CAG CAT GGC AGC CTT TTC CTT AAG ACA CCA AAA ATT GTC TCC AGC AAA GAT TAT AGT GTG ACT GCA AAC TCC AAG CTG GTC ATT ATC ACC GCG GGG GCC CGT CAG CAA GAG GGA GAG AGC CGG CTC AAT TTG GTC CAG CGA AAC GTG AAC ATC TTC AAG TTC ATC ATT CCA AAT GTT GTG AAA TAC AGT CCA CAG TGC AAA CTG CTC ATC GTC TCA AAC CCA GTG ATC TTG ACC TAC GTG GCT TGG AAG ATC AGC GGC TTC CCC AAA AAC AGA GTT ATT GGA AGT GGT AAT CTG GAT TCG GCT CGG TTC CGT TAC CTG ATG GGA GAA AGG CTG GGA GTT CAT CCA CTG AGC TGT CAC GGG GTC CTG GGA GAG CAT GGC GAC TCC AGT GTG CCT GTG AGT GGT GTG AAC GTC GCC GGC GTC TCC CTG AAG TCT CTG AAC CCG CAG CTG GGC ACG GAT GCA GAC AAG GAG CAG AAG GAT GTG CAC AAG CAG GTG GTT GAC AGT GCA TAC GAA GTG ATC AAG CTG AAA GGT TAC ACA TCC GCC ATT GGC CTC TCC GTG GCA GAC TTG GCC GAG AGC ATA ATG AAG AAC CTT AGG CGG GTG CAT CCC ATT TCC ACC ATG ATT GGT CTC TAT GGA ATC AAG GAG GAT GTC TTC CTC AGC GTC CCA TGT ATC CTG GGA CAA AAT GGA ATC TCA GAT GTT AAG GTG ACA CTG ACT CCT GAC GAG GAG GCC CGC CTG AAG AGT GCA GAT ACC CTC GGA ATC CAG AAG GAG CTG CAG TTC U13687Mus ATG GCA ACC CTC AAG GAC CAG CTG ATT GTG AAT CTT CTT AAG GAA GAG CAG GCT --- CCC CAG AAC AAG ATT ACA GTT GTT GGG GTT GGT GCT GTT GGC GCT TGT GCC ATC AGT ATC TTA ATG GAC TTG GCG GAT GAG CTT GCC CTT GTT GAC GTC ATG GAA GAC AAA CTC AAG GGC GAG ATG ATG GAT CTC CAG CAT GGC AGC CTC TTC CTT AAA ACA CCA AAA ATT GTC TCC AGC AAA GAC TAC TGT GTA ACT GCG AAC TCC AAG CTG GTC ATT ATC ACC GCG GGG GCC CGT CAG CAA GAG GGG GAG AGC CGG CTC AAC CTG GTC CAG CGA AAC GTG AAC ATC TTC AAG TTC ATC ATT CCC AAC ATT GTC AAG TAC AGT CCA CAC TGC AAG CTG CTG ATC GTC TCC AAT CCA GTG ATC TTG ACC TAC GTG GCT TGG AAA ATC AGT GGC TTT CCC AAA AAC CGA GTA ATT GGA AGT GGT AAT CTG GAT TCA GCG CGG TTC CGT TAC CTG ATG GGA GAG AGG CTG GGG GTT CAC GCG CTG AGC TGT CAC GGC GTC CTG GGA GAA CAT GGC GAC TCC AGT GTG CCT GTG AGT GGT GTG AAT GTT GCC GGC GTC TCC CTG AAG TCT CTT AAC CCA GAA CTG GGC ACT GAC GCA GAC AAG GAG CAG AAG GAG GTT CAC AAG CAG GTG GTG GAC AGT GCC TAC GAG GTG ATC AAG CTG AAA GGT TAC ACA TCC GCC ATT GGC CTC TCT GTG GCA GAC TTG GCT GAG AGC ATA ATG AAG AAC CTT AGG CGG GTG CAT CCC ATT TCC ACC ATG ATT GGT CTC TAT GGA ATC AAT GAG GAT GTC TTC CTC AGT GTC CCA TGT ATC CTG GGA CAA AAT GGA ATC TCG GAT GTT AAG GTG ACA CTG ACT CCT GAG GAA GAG GCC CGC CTG AAG AGC GCA GAC ACC CTC GGA ATC CAG AAG GAG CTG CAG TTC M22585rab ATG GCA GCT CTC AAG GAT CAG CTG ATT CAC AAC CTT CTG AAG GAA GAA CAT GTC --- CCC CAA AAT AAG ATC ACG GTT GTG GGG GTT GGT GCT GTG GGC GCC TGT GCC ATC AGT ATC TTA ATG GAC TTG GCG GAT GAA CTT GCT CTT GTT GAT GTC ATG GAA GAT AAA CTG AAG GGA GAG ATG ATG GAT CTC CAG CAT GGC AGC CTT TTC CTT AGA ACC CCC AAA ATT GTC TCT GGC AAG GAC TAC AGT GTG ACG GCC AAC TCC AAG CTG GTG ATC ATC ACG GCT GGG GCA CGG CAG CAA GAG GGA GAA AGC CGT CTG AAC TTG GTC CAG CGT AAC GTG AAC ATC TTC AAA TTC ATC ATT CCC AAT GTT GTC AAG TAC AGC CCC CAC TGC AAG TTG CTT GTT GTT TCC AAT CCA GTG ATC CTG ACC TAT GTG GCC TGG AAG ATA AGT GGC TTT CCC AAA AAC CGT GTG ATT GGA AGT GGT AAC CTG GAT TCA GCC CGC TTC CGT TAC CTG ATG GGG GAA AGG CTG GGA GTT CAC GCG CTG AGC TGT CAC GGC ATC CTG GGC GAG CAT GGA GAT TCA AGT GTG CCT GTG AGC GGC ATG AAC GTT GCT GGT GTC TCC CTG AAG ACT CTG CAC CCA GAG TTA GGC ACC GAT GCA GAC AAG GAA CAG AAA CAA GTG CAC AAA CAA GTG GTA GAC AGT GCT TAT GAG GTG ATC AAG CTG AAG GGC TAC ACT ACC GCC ATT GGA CTG TCT GTG GCA GAT CTG GCA GAG AGC ATA ATG AAG AAT CTC AGG AGG GTG CAT CCG ATT TCC ACC ATG CTT GGG CTC TAT GGA ATA AAG GAG GAT GTC TTC CTT AGT GTT CCT TGC GTC TTG GGA CAA AAT GGG ATC TCA GAC GTT AAG GTG ACT CTA ACC TCT GAA GAA GAG GCC CAC CTG AAG AGC GCG GAC ACG CTG GGA ATC CAA AAA GAG CTG CAG TTT AF070995C ATG TCC ACC GTC AAG GAG CAG CTA ATT CAG AAC CTA ACT CAA GAA GAT AAA ACC --- TCC CGG TGT AAG ATC ACT GTG GTG GGA GTT GGG AAT GTC GGC GCG TGT GCT ATT AGT ATC TTA CTG GAT TTG GCC GAT GAA CTG GCC CTT GTT GAC ACT GAT ACC GAC AAA CTG AAG GGA GAG ACG CTG GAT CTT CTG CAT GGC AGT CTT TTC TTC AAC ACT TCA AAG ATT GTC TCT GGA AAA GAT TAC AGT GTG TCT GCC AAC TCC AAA TTA GTT ATC ATC ACA GCC GGT GCT AGG CAG AAG GTG GGG GAA ACA CGC CTT GAC CTG GTC CAG CGT AAC GTT GCT ATC ATG AAA TCC ATC GTT CCT GGC TTA GTG CAA CAT AGT CCT GAC TGT AAA ATG CTG ATC GTC TCA AAC CCA GTG ATT TTG ACT TAT GTG GTC TGG AAG ATA AGT GGC CTG CCT GCA ACT CGT GTA ATT GGA AGT GGC AAC CTA GAT TCT GCC CGT TTC CGT TAC TTG ATT GGA GAG AAG TTG GGT GTC CAC CCT ACA AGT TGC CAC GGC GTT CTT GGA GAA CAC GGT GAC TCT AGT GTG CCC TTA AGT GGT GTG AAC GTT GCT GGC GTA CTT CTG AAG TCA CTG AAC CCA GCG TTA GGA AGC GAC TCA GAC CAA GAG CAC AAA AAG ATC CAC AAC CAA GTG GTG GAG AGT GGC TAT GAG GTC CTC CGG CTG AAG GGC TAT ACA TCT GCT ATT GGG CTG TCC GTG ACA GAT CTG GCA AGA TCA ATC CTG AAG AAT CTT AGG AGG GTG CAT CCC GTT TCC ACA CTG GTT GGC TTA TAT GAG ATA AAG GAA GAA ATC TTT CTC AGC ATT CCT TGT ATC TTG GGA CAA AAC GGC ATC ACA GAC ATT AAA GTG AAC CTG AAT CCC GAG GAG GAG GCC CTT CTC AGG AGT GCG GAA ACA CTC AAC GTC CAA AAG GAC CTC AAA TTG U95378Sus ATG TCA ACT GTC AAG GAG CAG CTT ATT GAG AAT CTA ATT GAA GAA GAT GAA GTC --- TCC CAG AGT AAG ATC ACC ATT GTT GGA ACC GGT GCT GTA GGC GCT TGT GCT ATT TGT ATC TTA TTG GAT TTG GCT GAT GAG CTT GCC CTT GTT GAT GTT GCA GTG GAC AAA CTG AAG GGA GAA ACA ATG GAT CTT CAG CAT GGC AGT CTT TTC TTC AAT ACT TCA AAG ATT GTC TCT GGA AAA GAT TAC AGT GTA TCT GCA AAC TCC AAA ATT GTT ATT GTC ACA GCA GGT GCA CGG CAG CAG GAG GGA GAA AGT CGC CTT GCC CTG GTC CAG CGT AAT GTG AAT ATC ATG AAA TCA ATC ATT CCT ACC ATA GTC CAA CAT AGT CCT GAC TGT AAG ATG CTT ATT GTT TCA AAT CCG GTG ATT TTG ACC TAC GTT GCT TGG AAG TTA AGT GGC TTA CCT GCA ACT CGT GTA ATT GGA AGT GGT AAT CTA GAC TCT GCC CGT TTC CGT TAC CTA ATT GGA AAG AAA TTG GGT GTA CAT CCC ACA AGC TGT CAT GGT ATT ATT GGA GAA CAT GGT GAC TCT AGT GTG CCT TTA AGT GGA GTA AAT GTT GCT GGT GTT GCT CTG AAG ACT CTT GAT CCT AAG TTA GGA ACT GAT TCA GAC AAG GAC CAG AAA AAT ATC CAT AAA CAA GTT ATT GGA AGT GCC TAT GAG ATT ATC AAG CTG AAG GGG TAT ACC TCT GCT ATT GGA CTG TCT GTG ACA GAT CTG GTA GGA TCA ATT TTG AAA AAT CTT AGG AGA GTG CAT CCA GTT TCT ACT ATG GTT GGC TTA TAC GGA ATA AAA GAA GAA ATC TTT CTC AGC ATC CCT TGT GTC TTG GGG CGA AAT GGT GTC TCA GAT ATT AAA GTT AAC TTG AAT GCT GAG GAG GAG GCC CTT TTC AAG AGT GCA AAC ACG CTT AAT GTC CAA AAA GAC TTG ACG TTT X04752Mus ATG TCC ACC GTC AAG GAG CAG CTG ATT CAG AAC CTA GTT CCG GAA GAT AAA CTT --- TCC CGG TGT AAG ATT ACT GTG GTC GGA GTT GGA AAT GTG GGC GCG TGT GCT ATT AGT ATT TTA CTG GGT TTG GCT GAT GAA CTT GCC CTT GTT GAC GCT GAT ACG AAC AAA CTG AGG GGA GAG GCA CTG GAT CTT CTG CAC GGC AGT CTT TTC CTT AGC ACT CCA AAA ATC GTC TTT GGA AAA GAT TAC AAT GTA TCT GCC AAC TCC AAA CTG GTT ATT ATC ACA GCT GGT GCA AGA ATG GTG TCT GGA GAA ACT CGC CTT GAC CTG CTC CAA CGT AAT GTC GCT ATC ATG AAA GCC ATT GTT CCG GGC ATT GTC CAA AAC AGT CCG GAC TGT AAA ATA ATT ATC GTC ACT AAC CCA GTG ATT TTG ACA TAC GTG GTT TGG AAG ATA AGC GGC TTC CCT GTA GGC CGT GTG ATC GGA AGT GGC AAC CTA GAC TCA GCA CGT TTT CGT TAC CTG ATT GGG GAG AAG CTG GGT GTC AAC CCT ACA AGC TGC CAC GGC GTT CTT GGA GAA CAT GGG GAC TCC AGT GTG CCC ATA AGT GGT GTA AAC GTT GCT GGC GTA ACT CTG AAG TCA CTG AAC CCA GCA ATA GGA ACT GAC TCA GAT AAG GAA CAC AAA AAT GTT CAC AAG CAG GTG GTG GAA GGC GGC TAT GAG GTC CTT AAC ATG AAG GGC TAT ACC TCT GCT ATC GGG CTG TCT GTG ACT GAT CTG GCG CGA TCC ATC TTG AAG AAT CTT AAG AGA GTG CAT CCT GTT ACC ACG CTG GTT GGC TTC CAT GGG ATA AAG GAA GAG GTC TTC CTC AGT ATC CCT TGT GTC TTG GGA CAA AGT GGT ATC ACA GAC TTT AAA GTC AAC ATG ACC GCT GAG GAG GAG GGT CTC CTC AAG AGT GCG GAC ACA CTC AAT ATG CAG AAG GAT CTG CAG TTA U07177Rat ATG TCC ACT GTC AAG GAG CAG CTA ATT CAG AAC CTA GCT CCA GAT GAA AAA CAA --- TCC CGG TGT AAG ATC ACT GTG GTC GGA GTT GGA AAT GTG GGC GCG TGT GCC ATT AGT ATT TTA CTG GGT CTG GCT GAT GAA CTT GCC CTT GTT GAT GCT GAT GAG AAC AAA CTG AAG GGA GAG GCA CTG GAT CTT CTG CAT GGC AGC CTT TTC CTC AGC ACT CCA AAA ATC GTC TTT GGA AAA GAT TAC AGT GTA TCT GCC AAC TCC AAA CTG GTT ATT ATC ACT GCT GGT GCA AGA ATG GTG AGT GGA GAA TCT CGT CTT GCC CTG CTC CAA CGT AAT GTC ACA TCT ATG AAA GCC ATC GTT CCC GGC GTA ATC CAA AAC AGT CCG GAC TGT AAA ATA ATG ATT GTC ACA AAC CCA GTC ATT TTG ACA TAC GTG GTT TGG AAG ATA AGT GGC CTC CCT GTA AGC AGT GTG ATT GGA AGT GGC AAC CTA GAC TCC GCT CGT TTC CGT TAC CTG ATT GGA GAG AAG CTG GGT GTC AAC CCT TCG AGC TGC CAT GGC GTT CTT GGA GAA CAT GGG GAC TCC AGT GTG CCC ATA AGT GGT GTG AAC ATT GCT GGC GTA ACT CTG AAG TCA CTG AAC CCA GCA ATA GGA TCC GAC TCC GAT AAG GAA CAG AAA ACC GTT CAC AAG CAG GTG GTG GAT GGT GGC TAT GAG GTC CTT AAC CTG AAG GGC TAT ACC TCT GCC ATT GCG CTG TCT GTG ACT GAT ATC GCT GCA TCA ATC TTG AAG AAT CTT AAG AGG GTG CAT GCT GTT ACT ACG CTG GTT GGC TTA TAT GGG ATA AAG GAA GAA ATC TTC CTC AGT ATC CCG TGT GTC TTG GGA CAA AGT GGC ATC ACA GAC CTT AAA GTC AAC ATG AAC ACC GAG GAG GAA GCT CTT TTT AAG AGT TGC GAC ATA CTC AAC ATC CAG AAA GAT CTG CAA TTA U13680Hom ATG TCA ACT GTC AAG GAG CAG CTA ATT GAG AAG CTA ATT GAG GAT GAT GAA AAC --- TCC CAG TGT AAA ATT ACT ATT GTT GGA ACT GGT GCC GTA GGC GCT TGT GCT ATT AGT ATC TTA CTG GAT TTG GCT GAT GAA CTT GCC CTT GTT GAT GTT GCA TTG GAC AAA CTG AAG GGA GAA ATG ATG GAT CTT CAG CAT GGC AGT CTT TTC TTT AGT ACT TCA AAG ATT ACT TCT GGA AAA GAT TAC AGT GTA TCT GCA AAC TCC AGA ATA GTT ATT GTC ACA GCA GGT GCA AGG CAG CAG GAG GGA GAA ACT CGC CTT GCC CTG GTC CAA CGT AAT GTG GCT ATA ATG AAA TCA ATC ATT CCT GCC ATA GTC CAT TAT AGT CCT GAT TGT AAA ATT CTT GTT GTT TCA AAT CCA GTG ATT TTG ACA TAT ATA GTC TGG AAG ATA AGT GGC TTA CCT GTA ACT CGT GTA ATT GGA AGT GGT AAT CTA GAC TCT GCC CGT TTC CGT TAC CTA ATT GGA GAA AAG TTG GGT GTC CAC CCC ACA AGC TGC CAT GGT ATT ATT GGA GAA CAT GGT GAT TCT AGT GTG CCC TTA AGT GGG GTG AAT GTT GCT GGT GTT GCT CTG AAG ACT CTG GAC CCT AAA TTA GGA ACG GAT TCA GAT AAG GAA CAC AAA AAT ATC CAT AAA CAA GTT ATT CAA AGT GCC TAT GAA ATT ATC AAG CTG AAG GGG TAT ACC TCT GCT ATT GGA CTG TCT GTG ATG GAT CTG GTA GGA TCC ATT TTG AAA AAT CTT AGG AGA GTG CAC CCA GTT TCC ACC ATG GTT GGA TTA TAT GGA ATA AAA GAA GAA CTC TTT CTC AGT ATC CCT TGT GTC TTG GGG CGG AAT GGT GTC TCA GAT GTT AAA ATT AAC TTG AAT TCT GAG GAG GAG GCC CTT TTC AAG AGT GCA GAA ACA CTT AAT ATT CAA AAG GAT CTA ATA TTT X53828OG1 ATG TCT --- CTC AAG GAT CAT CTC ATC CAC AAT GTC CAC AAA GAG GAG CAC GCT CAT GCC CAC AAC AAG ATC AGC GTG GTT GGT GTG GGT GCA GTT GGA GCT TGT GCC ATC AGC ATC CTG ATG GAC TTG GCA GAT GAA CTT ACC CTT GTT GAT GTT GTG GAG GAC AAG CTG AAA GGA GAA ATG CTT GAT CTC CAG CAT GGC AGC CTC TTC CTC AAA ACA CCA AAG ATT ATA TCT GGC AAA GAT TAC AGC GTG ACT GCA CAC TCC AAG CTG GTC ATT GTC ACT GCT GGT GCC CGT CAG CAA GAA GGA GAA AGC CGT CTT AAC TTG GTC CAA CGC AAT GTC AAT ATC TTC AAA TTC ATC ATT CCC AAT GTT GTG AAA TAC AGT CCT GAC TGC AAG CTG CTG ATT GTC TCA AAC CCA GTG ATT TTG ACC TAT GTG GCC TGG AAG ATC AGT GGC TTT CCT AAA CAC CGT GTT ATC GGT AGT GGC AAT CTG GAC TCA GCC CGT TTC CGC CAC CTC ATG GGA GAA AGA CTG GGC ATC CAT CCT CTG AGC TGC CAT GGG ATT GTT GGA GAG CAT GGA GAC TCC AGT GTG CCT GTC AGC GGA GTG AAT GTT GCT GGT GTC TCC CTG AAG GCT CTT CAT CCA GAC ATG GGA ACT GAT GCA GAC AAG GAG CAC AAG GAG GTT CAC AAG CAG GTG GTG GAC AGT GCC TAT GAG GTC ATC AAA CTG AAG GGT TAC ACA TCA GCT ATT GGC CTT TCT GTG GCA GAT CTA GCT GAA ACT ATC ATG AAG AAC TTA AGA AGA GTG CAC CCA ATC TCT ACA GCT GTT GGC ATG CAC GGA ATA AAA GAT GAT GTC TTC CTA AGT GTT CCT TGT GTA CTG GGC AGC AGT GGC ATC ACT GAT GTA AAG ATG ATC CTA AAA CCT GAT GAA GAG GAG AAA ATA AAG AGC GCA GAT ACA CTC GGA ATT CAG AAA GAA CTA CAG TTT U28410OG2 ATG TCT --- CTC AAG GAG AAG CTG ATC GTA AAT GTT CAC AAA GAA GAG CAG CCC CAT GCC CAC AAC AAG ATC ACT GTG GTT GGG GTT GGT GCA GTT GGC GCT TGT GCC ATA AGT ATT TTG ATG GAC TTG GCT GAT GAA CTT GCC CTT GTT GAT GTC ATA GAG GAC AAG CTG AAA GGG GAA ATG CTG GAC CTC CAG CAT GGA AGC CTC TTT CTC AGG ACA CCA AAG ATT GTT TCT GGC AAA GAC TAT GCT GTG ACT GCA CAC TCC AAG CTG GTC ATC ATC ACT GCT GGA GCA CGC CAG CAA GAA GGT GAA TCT CGC CTC AAC TTG GTT CAG CGC AAT GTG AAC ATC TTC AAA TTC ATC ATT CCT AAT GTT GTC AAG TAC AGT CCC GAC TGC AAG CTG CTT GTT GTT TCC AAT CCA GTG ATT CTG ACC TAC GTG GCA TGG AAG ATC AGT GGC TTT CCT AAG CAC CGT GTT ATT GGA AGT GGT AAT CTG GAC TCT GCC CGT TTC CGC CAC CTG ATG GCT GAA AAG TTG GGG ATC CAC CCT CTC AGC TGC CAT GGC ATT GTT GGG GAG CAT GGA GAC TCC AGC GTG CCT GTC AGT GGT GTG AAT GTT GCT GGC GTC TCT CTG AAA GGC TTA CAT CCT GAC ATG GGG ACT GAT GGT GAC AAG GAG AAC AAA CAG GTC CAC AAG CAA GTG GTA GAC AGT GCT TAT GAG GTT ATC AAG CTG AAG GGG TAC ACA TCC GCA ATT GGT CTC TCT GTG GCT GAT CTA GCT GAA ACC ATC ATG AAA AAT TTA CGA AGA GTA CAT CCA GTT TCT ACA ATG GTA GGC ATG CAC GGA ATT AAC GAT GAT GTC TTC CTG AGT GTT CCT TGT GTC CTG GGC TAC TCA GGA ATT ACA GAT GTT AAA ATG ACT CTG AAG AGT GAG GAG GAA GAT AAA TTG AGG AGT GCA GAT ACA CTC GGA ATC CAG AAG GAG CTT CAG TTT 2 1 1 1 4 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 6 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 CODONML (in paml version 4, June 2007) seqfile.txt Model: several dN/dS ratios for branches Codon frequencies: F3x4 ns = 12 ls = 333 Codon usage in sequences -------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Phe TTT 3 3 0 1 2 1 | Ser TCT 4 4 1 2 3 5 | Tyr TAT 3 4 2 1 3 4 | Cys TGT 2 2 3 4 2 5 TTC 4 4 7 6 5 3 | TCC 4 4 7 7 4 6 | TAC 5 3 5 6 4 2 | TGC 3 3 2 2 3 1 Leu TTA 3 2 1 1 2 6 | TCA 3 2 2 1 3 5 | *** TAA 0 0 0 0 0 0 | *** TGA 0 0 0 0 0 0 TTG 8 7 4 3 4 6 | TCG 0 0 1 1 0 0 | TAG 0 0 0 0 0 0 | Trp TGG 6 6 6 6 6 6 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Leu CTT 13 10 8 7 8 8 | Pro CCT 3 5 2 2 2 5 | His CAT 3 6 4 3 4 3 | Arg CGT 6 5 2 2 4 4 CTC 3 3 7 9 4 5 | CCC 2 3 3 4 5 3 | CAC 4 6 2 4 7 5 | CGC 0 0 1 1 1 1 CTA 2 3 1 0 1 3 | CCA 5 3 6 5 2 2 | Gln CAA 4 3 2 2 6 6 | CGA 1 0 1 2 0 0 CTG 9 11 16 17 19 16 | CCG 1 1 1 0 1 0 | CAG 8 6 12 10 6 4 | CGG 1 2 3 3 1 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Ile ATT 10 10 9 10 6 9 | Thr ACT 6 5 2 3 3 6 | Asn AAT 10 11 5 6 5 3 | Ser AGT 9 8 8 8 7 11 ATC 9 11 13 13 12 12 | ACC 3 3 4 5 6 3 | AAC 5 5 9 9 8 12 | AGC 4 5 7 6 7 2 ATA 4 3 2 1 3 2 | ACA 4 3 4 4 0 8 | Lys AAA 9 13 6 7 7 9 | Arg AGA 1 0 1 0 1 1 Met ATG 9 9 8 9 10 4 | ACG 1 1 1 0 4 1 | AAG 19 13 22 20 20 16 | AGG 2 4 2 2 3 4 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Val GTT 14 17 10 9 10 9 | Ala GCT 7 8 5 5 6 5 | Asp GAT 14 12 12 6 11 9 | Gly GGT 5 5 5 5 3 4 GTC 7 5 11 10 8 9 | GCC 4 3 8 7 7 6 | GAC 4 4 7 11 6 9 | GGC 4 6 7 9 9 11 GTA 4 2 0 2 1 2 | GCA 7 7 6 4 5 2 | Glu GAA 9 10 5 5 9 7 | GGA 10 9 10 7 9 8 GTG 9 12 16 14 17 15 | GCG 0 2 1 5 3 3 | GAG 9 9 11 14 9 10 | GGG 7 6 3 4 5 3 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Phe TTT 2 3 2 3 2 3 | Ser TCT 7 4 5 7 4 7 | Tyr TAT 2 2 3 5 2 2 | Cys TGT 6 5 5 5 2 2 TTC 4 4 3 3 5 4 | TCC 2 5 7 4 3 4 | TAC 4 3 3 2 3 4 | TGC 0 1 2 1 3 3 Leu TTA 6 2 3 5 1 2 | TCA 7 3 2 6 3 1 | *** TAA 0 0 0 0 0 0 | *** TGA 0 0 0 0 0 0 TTG 8 4 3 7 3 5 | TCG 0 0 1 0 0 0 | TAG 0 0 0 0 0 0 | Trp TGG 6 6 6 6 6 6 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Leu CTT 11 10 10 9 6 4 | Pro CCT 6 4 2 5 6 6 | His CAT 7 3 4 5 7 6 | Arg CGT 4 4 4 4 4 2 CTC 1 5 5 2 7 8 | CCC 1 1 2 2 1 2 | CAC 0 4 1 3 11 8 | CGC 1 1 0 1 2 4 CTA 3 2 3 5 4 1 | CCA 1 3 4 2 4 3 | Gln CAA 3 3 5 4 2 2 | CGA 1 1 0 0 0 1 CTG 6 15 15 8 11 13 | CCG 1 3 2 0 0 0 | CAG 7 5 5 5 5 7 | CGG 1 1 1 1 0 0 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Ile ATT 19 10 10 20 8 9 | Thr ACT 6 7 7 8 5 5 | Asn AAT 12 6 3 9 6 7 | Ser AGT 11 9 12 12 7 9 ATC 8 9 11 5 14 11 | ACC 5 4 3 2 2 2 | AAC 3 11 13 3 4 5 | AGC 2 3 4 1 9 3 ATA 2 5 6 7 3 2 | ACA 4 5 4 4 4 5 | Lys AAA 11 9 10 11 12 9 | Arg AGA 1 2 1 2 3 1 Met ATG 6 7 6 7 9 10 | ACG 2 2 1 1 0 0 | AAG 16 16 16 15 18 20 | AGG 1 1 1 2 0 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Val GTT 12 11 9 12 11 17 | Ala GCT 9 8 9 7 8 9 | Asp GAT 11 9 11 15 13 10 | Gly GGT 8 6 5 8 6 6 GTC 9 11 10 8 10 8 | GCC 5 3 6 7 6 4 | GAC 7 8 6 3 8 10 | GGC 4 12 11 3 9 8 GTA 6 4 4 5 2 4 | GCA 6 4 4 5 6 6 | Glu GAA 8 7 8 11 8 8 | GGA 13 9 10 12 10 7 GTG 7 12 12 7 14 10 | GCG 0 3 2 0 0 0 | GAG 8 8 7 7 9 9 | GGG 2 4 2 3 1 6 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Codon position x base (3x4) table for each sequence. #1: X02152Hom position 1: T:0.14458 C:0.19578 A:0.31627 G:0.34337 position 2: T:0.33434 C:0.16265 A:0.31928 G:0.18373 position 3: T:0.33735 C:0.19578 A:0.19880 G:0.26807 Average T:0.27209 C:0.18474 A:0.27811 G:0.26506 #2: U07178Sus position 1: T:0.13253 C:0.20181 A:0.31325 G:0.35241 position 2: T:0.33735 C:0.16265 A:0.31627 G:0.18373 position 3: T:0.34639 C:0.20482 A:0.18072 G:0.26807 Average T:0.27209 C:0.18976 A:0.27008 G:0.26807 #3: NM017025Rat position 1: T:0.12349 C:0.21386 A:0.31024 G:0.35241 position 2: T:0.34036 C:0.16265 A:0.31325 G:0.18373 position 3: T:0.23494 C:0.30120 A:0.14157 G:0.32229 Average T:0.23293 C:0.22590 A:0.25502 G:0.28614 #4: U13687Mus position 1: T:0.12349 C:0.21386 A:0.31024 G:0.35241 position 2: T:0.33735 C:0.16566 A:0.31325 G:0.18373 position 3: T:0.22289 C:0.32831 A:0.12349 G:0.32530 Average T:0.22791 C:0.23594 A:0.24900 G:0.28715 #5: M22585rab position 1: T:0.12349 C:0.21386 A:0.30723 G:0.35542 position 2: T:0.33735 C:0.16265 A:0.31627 G:0.18373 position 3: T:0.23795 C:0.28916 A:0.14759 G:0.32530 Average T:0.23293 C:0.22189 A:0.25703 G:0.28815 #6: AF070995C position 1: T:0.15060 C:0.20181 A:0.31024 G:0.33735 position 2: T:0.33133 C:0.18072 A:0.29819 G:0.18976 position 3: T:0.27410 C:0.27108 A:0.18373 G:0.27108 Average T:0.25201 C:0.21787 A:0.26406 G:0.26606 #7: U95378Sus position 1: T:0.16265 C:0.16265 A:0.32831 G:0.34639 position 2: T:0.33133 C:0.18675 A:0.29819 G:0.18373 position 3: T:0.40060 C:0.16867 A:0.21687 G:0.21386 Average T:0.29819 C:0.17269 A:0.28112 G:0.24799 #8: X04752Mus position 1: T:0.12651 C:0.19578 A:0.31928 G:0.35843 position 2: T:0.34337 C:0.17771 A:0.28313 G:0.19578 position 3: T:0.30422 C:0.25602 A:0.17771 G:0.26205 Average T:0.25803 C:0.20984 A:0.26004 G:0.27209 #9: U07177Rat position 1: T:0.13554 C:0.18976 A:0.32530 G:0.34940 position 2: T:0.33735 C:0.18373 A:0.28614 G:0.19277 position 3: T:0.30422 C:0.26205 A:0.19277 G:0.24096 Average T:0.25904 C:0.21185 A:0.26807 G:0.26104 #10: U13680Hom position 1: T:0.16265 C:0.16867 A:0.32831 G:0.34036 position 2: T:0.34036 C:0.18072 A:0.29518 G:0.18373 position 3: T:0.40361 C:0.15060 A:0.23795 G:0.20783 Average T:0.30221 C:0.16667 A:0.28715 G:0.24398 #11: X53828OG1 position 1: T:0.11145 C:0.21084 A:0.31325 G:0.36446 position 2: T:0.33133 C:0.15663 A:0.32530 G:0.18675 position 3: T:0.29217 C:0.29217 A:0.18675 G:0.22892 Average T:0.24498 C:0.21988 A:0.27510 G:0.26004 #12: U28410OG2 position 1: T:0.12952 C:0.20181 A:0.30120 G:0.36747 position 2: T:0.33434 C:0.16265 A:0.32229 G:0.18072 position 3: T:0.31325 C:0.26506 A:0.15663 G:0.26506 Average T:0.25904 C:0.20984 A:0.26004 G:0.27108 Sums of codon usage counts ------------------------------------------------------------------------------ Phe F TTT 25 | Ser S TCT 53 | Tyr Y TAT 33 | Cys C TGT 43 TTC 52 | TCC 57 | TAC 44 | TGC 24 Leu L TTA 34 | TCA 38 | *** * TAA 0 | *** * TGA 0 TTG 62 | TCG 3 | TAG 0 | Trp W TGG 72 ------------------------------------------------------------------------------ Leu L CTT 104 | Pro P CCT 48 | His H CAT 55 | Arg R CGT 45 CTC 59 | CCC 29 | CAC 55 | CGC 13 CTA 28 | CCA 40 | Gln Q CAA 42 | CGA 7 CTG 156 | CCG 10 | CAG 80 | CGG 16 ------------------------------------------------------------------------------ Ile I ATT 130 | Thr T ACT 63 | Asn N AAT 83 | Ser S AGT 111 ATC 128 | ACC 42 | AAC 87 | AGC 53 ATA 40 | ACA 49 | Lys K AAA 113 | Arg R AGA 14 Met M ATG 94 | ACG 14 | AAG 211 | AGG 24 ------------------------------------------------------------------------------ Val V GTT 141 | Ala A GCT 86 | Asp D GAT 133 | Gly G GGT 66 GTC 106 | GCC 66 | GAC 83 | GGC 93 GTA 36 | GCA 62 | Glu E GAA 95 | GGA 114 GTG 145 | GCG 19 | GAG 110 | GGG 46 ------------------------------------------------------------------------------ (Ambiguity data are not used in the counts.) Codon position x base (3x4) table, overall position 1: T:0.13554 C:0.19754 A:0.31526 G:0.35166 position 2: T:0.33635 C:0.17043 A:0.30723 G:0.18599 position 3: T:0.30597 C:0.24874 A:0.17871 G:0.26657 Average T:0.25929 C:0.20557 A:0.26707 G:0.26807 Codon frequencies under model, for use in evolver (TTT TTC TTA TTG ... GGG): 0.01427812 0.01160756 0.00833964 0.01243918 0.00723496 0.00588174 0.00422583 0.00630314 0.01304210 0.01060273 0.00000000 0.00000000 0.00789559 0.00641881 0.00000000 0.00687868 0.02080904 0.01691695 0.01215425 0.01812896 0.01054428 0.00857209 0.00615876 0.00918624 0.01900766 0.01545249 0.01110209 0.01655959 0.01150709 0.00935482 0.00672112 0.01002504 0.03320985 0.02699833 0.01939739 0.02893262 0.01682798 0.01368050 0.00982897 0.01466063 0.03033497 0.02466116 0.01771821 0.02642800 0.01836455 0.01492967 0.01072647 0.01599931 0.03704379 0.03011517 0.02163673 0.03227277 0.01877070 0.01525985 0.01096369 0.01635314 0.03383702 0.02750819 0.01976370 0.02947901 0.02048466 0.01665324 0.01196479 0.01784636 TREE # 1: (1, 2, (5, ((3, 4), (((6, (8, 9)), (7, 10)), (11, 12))))); MP score: -1 lnL(ntime: 21 np: 24): -5985.635237 +0.000000 13..1 13..2 13..14 14..5 14..15 15..16 16..3 16..4 15..17 17..18 18..19 19..6 19..20 20..8 20..9 18..21 21..7 21..10 17..22 22..11 22..12 0.171224 0.151409 0.058980 0.269203 0.017888 0.262039 0.138108 0.103579 0.168914 0.560187 0.231662 0.203731 0.272797 0.130747 0.204423 0.162430 0.151155 0.167095 0.366793 0.312140 0.396584 2.403414 0.075516 0.239425 Note: Branch length is defined as number of nucleotide substitutions per codon (not per neucleotide site). tree length = 4.50108 (1: 0.171224, 2: 0.151409, (5: 0.269203, ((3: 0.138108, 4: 0.103579): 0.262039, (((6: 0.203731, (8: 0.130747, 9: 0.204423): 0.272797): 0.231662, (7: 0.151155, 10: 0.167095): 0.162430): 0.560187, (11: 0.312140, 12: 0.396584): 0.366793): 0.168914): 0.017888): 0.058980); (X02152Hom: 0.171224, U07178Sus: 0.151409, (M22585rab: 0.269203, ((NM017025Rat: 0.138108, U13687Mus: 0.103579): 0.262039, (((AF070995C: 0.203731, (X04752Mus: 0.130747, U07177Rat: 0.204423): 0.272797): 0.231662, (U95378Sus: 0.151155, U13680Hom: 0.167095): 0.162430): 0.560187, (X53828OG1: 0.312140, U28410OG2: 0.396584): 0.366793): 0.168914): 0.017888): 0.058980); Detailed output identifying parameters kappa (ts/tv) = 2.40341 dN & dS for each branch branch t N S dN/dS dN dS N*dN S*dS 13..1 0.171 729.3 269.7 0.0755 0.0133 0.1756 9.7 47.3 13..2 0.151 729.3 269.7 0.0755 0.0117 0.1552 8.5 41.9 13..14 0.059 729.3 269.7 0.0755 0.0046 0.0605 3.3 16.3 14..5 0.269 729.3 269.7 0.0755 0.0208 0.2760 15.2 74.4 14..15 0.018 729.3 269.7 0.0755 0.0014 0.0183 1.0 4.9 15..16 0.262 729.3 269.7 0.0755 0.0203 0.2687 14.8 72.5 16..3 0.138 729.3 269.7 0.0755 0.0107 0.1416 7.8 38.2 16..4 0.104 729.3 269.7 0.0755 0.0080 0.1062 5.8 28.6 15..17 0.169 729.3 269.7 0.0755 0.0131 0.1732 9.5 46.7 17..18 0.560 729.3 269.7 0.2394 0.1005 0.4198 73.3 113.2 18..19 0.232 729.3 269.7 0.2394 0.0416 0.1736 30.3 46.8 19..6 0.204 729.3 269.7 0.2394 0.0366 0.1527 26.7 41.2 19..20 0.273 729.3 269.7 0.2394 0.0490 0.2045 35.7 55.1 20..8 0.131 729.3 269.7 0.2394 0.0235 0.0980 17.1 26.4 20..9 0.204 729.3 269.7 0.2394 0.0367 0.1532 26.8 41.3 18..21 0.162 729.3 269.7 0.2394 0.0291 0.1217 21.3 32.8 21..7 0.151 729.3 269.7 0.2394 0.0271 0.1133 19.8 30.6 21..10 0.167 729.3 269.7 0.2394 0.0300 0.1252 21.9 33.8 17..22 0.367 729.3 269.7 0.0755 0.0284 0.3761 20.7 101.4 22..11 0.312 729.3 269.7 0.0755 0.0242 0.3200 17.6 86.3 22..12 0.397 729.3 269.7 0.0755 0.0307 0.4066 22.4 109.7 tree length for dN: 0.56113 tree length for dS: 4.04015 dS tree: (X02152Hom: 0.175561, U07178Sus: 0.155244, (M22585rab: 0.276022, ((NM017025Rat: 0.141606, U13687Mus: 0.106203): 0.268676, (((AF070995C: 0.152691, (X04752Mus: 0.097991, U07177Rat: 0.153209): 0.204454): 0.173624, (U95378Sus: 0.113287, U13680Hom: 0.125233): 0.121737): 0.419845, (X53828OG1: 0.320046, U28410OG2: 0.406630): 0.376085): 0.173193): 0.018341): 0.060474); dN tree: (X02152Hom: 0.013258, U07178Sus: 0.011723, (M22585rab: 0.020844, ((NM017025Rat: 0.010693, U13687Mus: 0.008020): 0.020289, (((AF070995C: 0.036558, (X04752Mus: 0.023462, U07177Rat: 0.036682): 0.048951): 0.041570, (U95378Sus: 0.027124, U13680Hom: 0.029984): 0.029147): 0.100521, (X53828OG1: 0.024169, U28410OG2: 0.030707): 0.028400): 0.013079): 0.001385): 0.004567); w ratios as labels for TreeView: (X02152Hom #0.0755 : 0.013258, U07178Sus #0.0755 : 0.011723, (M22585rab #0.0755 : 0.020844, ((NM017025Rat #0.0755 : 0.010693, U13687Mus #0.0755 : 0.008020) #0.0755 : 0.020289, (((AF070995C#1 #0.2394 : 0.036558, (X04752Mus#1 #0.2394 : 0.023462, U07177Rat#1 #0.2394 : 0.036682)#1 #0.2394 : 0.048951)#1 #0.2394 : 0.041570, (U95378Sus#1 #0.2394 : 0.027124, U13680Hom#1 #0.2394 : 0.029984)#1 #0.2394 : 0.029147)#1 #0.2394 : 0.100521, (X53828OG1 #0.0755 : 0.024169, U28410OG2 #0.0755 : 0.030707) #0.0755 : 0.028400) #0.0755 : 0.013079) #0.0755 : 0.001385) #0.0755 : 0.004567); Time used: 0:37