Difference between revisions of "EleGen"
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^ the type can be 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 X | ^ the type can be 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 X | ||
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| + | #rR X=exon 9=FirstExon 8=5UTR 7=3UTR 6=Boundary 5=Promoter 4=Intron 3=1to5kb 2=Enhancer 1=Intergen (voir AnnotType) | ||
| + | #rR On crée aussi un Final qui contient ces types en mettant en priorité X puis 9 puis 8 ... | ||
| + | #rR le 9 8 7 sont sytématiquement écrasés par X car ce sont aussi des eXons | ||
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Latest revision as of 14:14, 20 July 2020
EleGen Eléments Génomiques .. Pour Homo sapiens
C'est une procédure de gscope qui marche à merveille !
EleGen permet d'interrgoger les annotations des ELEments du GENome
EleGen Chr01 X ListOf Gn
EleGen Chr01 X NOTCH2 ListOfD
EleGen Chr01 X NOTCH2 ListOfF
EleGen Chr01 X NOTCH2 ListOfId
EleGen Chr01 X ListOf Id
EleGen Chr01 X ListOf All
EleGen Chr01 X exon:57053 D
EleGen Chr01 6 ListOf Id
^ the type can be 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 X
#rR X=exon 9=FirstExon 8=5UTR 7=3UTR 6=Boundary 5=Promoter 4=Intron 3=1to5kb 2=Enhancer 1=Intergen (voir AnnotType) #rR On crée aussi un Final qui contient ces types en mettant en priorité X puis 9 puis 8 ... #rR le 9 8 7 sont sytématiquement écrasés par X car ce sont aussi des eXons
utilisable en procédure normale ou
- par le Café des sciences
qds Zero EleGen Chr01 X ListOf Id
- ou en web
http://lbgi.fr/wscoperr?Zero&EleGen&Chr01&X&ListOf&Gn
