IBISSA

IBISSA : Intelligent BioInformatics Solutions Software Architecture

Est un projet initié par Frédéric Plewniak et Sophie Candel basé sur UIMA pour optimiser le développement en bioinformatique.

sources

Une petite présentation.


Créer un projet IBISSA sur Star:

Désormais, Eclipse et UIMA sont installés en local sur les Star.
Pour lancer Eclipse il faut taper depuis une fenetre de commande:
>eclipse-uima

Si c'est la première fois que vous vous connectez, choisissez un espace de travail.
Vous devez ensuite importer le projet "examples" dans Eclipse:
File>>Import>>General>>Existing Projects into Workspace>>
Sélectionnez le dossier /local/ibissa/apache-uima/examples
Attention: il faut activer la copie du projet sur votre espace de travail

Une fois que c'est fait il ne vous reste plus qu'a paramétrer la variable UIMA_HOME:
Window>>Preference>>Java>>Build Path>> Classpath Variables>> New
Name: UIMA_HOME
Value: /local/ibissa/apache-uima

Amusez-vous bien ;o)