IBISSA
IBISSA : Intelligent BioInformatics Solutions Software Architecture
Est un projet initié par Frédéric Plewniak et Sophie Candel basé sur UIMA pour optimiser le développement en bioinformatique.
Créer un projet IBISSA sur Star
Désormais, Eclipse et UIMA sont installés en local sur les Star.
Pour lancer Eclipse il faut taper depuis une fenêtre de commande Star activée XWindows.
NB: Utilisez Star3,5,6,7 ou 8.
>eclipse-uima
Si c'est la première fois que vous vous connectez, choisissez un espace de travail.
Une fois que c'est fait vous devez paramétrer la variable UIMA_HOME:
Window>>Preference>>Java>>Build Path>> Classpath Variables>> New
Name: UIMA_HOME
Value: /local/ibissa/apache-uima
Vous devez ensuite importer le projet "examples" dans Eclipse:
File>>Import>>General>>Existing Projects into Workspace>>
Sélectionnez le dossier /local/ibissa/apache-uima/examples
Attention: il faut activer la copie du projet sur votre espace de travail.
Amusez-vous bien ;o)
