Difference between revisions of "BIRD"

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'''La suite est obsolète La suite est obsolète La suite est obsolète La suite est obsolète
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  '''La suite est obsolète La suite est obsolète La suite est obsolète La suite est obsolète '''  
 
 
La suite est obsolète La suite est obsolète La suite est obsolète La suite est obsolète
 
 
 
La suite est obsolète La suite est obsolète La suite est obsolète La suite est obsolète'''  
 
 
 
 
   Il se peut qu'il faille encore faire '''setbird''' avant de lancer gscope
 
   Il se peut qu'il faille encore faire '''setbird''' avant de lancer gscope
 
   La suite est à confirmer par un bon vieux '''[[oue]]'''
 
   La suite est à confirmer par un bon vieux '''[[oue]]'''

Revision as of 08:24, 12 October 2007

BIRD

Le site web de Hoan

Bird ... sa Javadoc

Gscope utilise BIRD

Gscope peut se mettre maintenant en connexion directe avec Bird

proc BirdFromQueryText {Texte {OutFile ""} {BirdUrl ""}} proc BirdFromQueryFile {Fichier {OutFile ""} {BirdUrl ""}}


 La suite est obsolète La suite est obsolète La suite est obsolète La suite est obsolète  
 Il se peut qu'il faille encore faire setbird avant de lancer gscope
 La suite est à confirmer par un bon vieux oue
 * les procédures qui font appel au web service :
 ** proc BirdGetFields {NM field1,field2}   rend field1=fff  field2=zzz
 ** proc BirdGet {NM field}                 rend simplement la valeur du champ
 * proc Bird {Query {Format ""} {Out ""}}   en exec sur nos machines qui ont Java
 ** [exec bird_explorer_ucsc $FichierQuery $OutFile format=$Format display=yes]
 * proc BirdSendQueryAndGetFromUrl {Query {Url ""} {Options ""}}
 ** ::http::geturl http://star4:8080/mybiodb/bsearch -query $QueryEncode $Option
 * proc BirdSendQueryUrlAndGetFromUrl {QueryUrl {Url ""} {Options ""}}
 ** ::http::geturl ::http::geturl http://star4:8080/mybiodb/bsearch -query $QueryUrlEncode $Option
 * proc BirdPostFileAndGetFromUrl {Filename {Url ""} {Options ""}}
 ** ::http::geturl ::http::geturl http://star4:8080/mybiodb/bsearch -query $PostEncode