Difference between revisions of "Cluspack"
(New page: Cluspack permet de lancer un clustering en k-means ou en mixture-models Input format: Des données doivent commencer avec une ligne indiquant le nombre des lignes et des colonnes. La prem...) |
|||
| Line 1: | Line 1: | ||
Cluspack permet de lancer un clustering en k-means ou en mixture-models | Cluspack permet de lancer un clustering en k-means ou en mixture-models | ||
| − | Input format: | + | '''Input format''': |
| − | Des données doivent commencer avec une ligne indiquant le nombre des lignes et des colonnes. | + | Des données doivent commencer avec une première ligne indiquant le nombre des lignes et des colonnes. |
La première colonne des données peut contenir des identifiants (et toutes autres colonne de texte, annotation etc devront se touver à la fin) | La première colonne des données peut contenir des identifiants (et toutes autres colonne de texte, annotation etc devront se touver à la fin) | ||
| − | Utilisation: | + | '''Utilisation''' : |
| − | pour utiliser le GUI crée par Adeline et Nicolas | + | pour utiliser le GUI crée par Adeline et Nicolas : |
| + | |||
setcluspack | setcluspack | ||
| + | |||
cluspackX | cluspackX | ||
| − | Il existe aussi une variante de clustering itérative en ligne de commande: | + | |
| + | |||
| + | Il existe aussi une variante de '''clustering itérative''' en ligne de commande: | ||
(cet exemple lancera 10 fois un clustering kMeans) | (cet exemple lancera 10 fois un clustering kMeans) | ||
| + | |||
/biolo/cluspack/cluspacksucc.tcl myDataForClustering.txt kmeans 10 | /biolo/cluspack/cluspacksucc.tcl myDataForClustering.txt kmeans 10 | ||
| + | |||
Attention : cluspack marche seulement sur des serveurs "star" et plus sur beaufort !! | Attention : cluspack marche seulement sur des serveurs "star" et plus sur beaufort !! | ||
Revision as of 13:11, 27 September 2007
Cluspack permet de lancer un clustering en k-means ou en mixture-models
Input format: Des données doivent commencer avec une première ligne indiquant le nombre des lignes et des colonnes. La première colonne des données peut contenir des identifiants (et toutes autres colonne de texte, annotation etc devront se touver à la fin)
Utilisation : pour utiliser le GUI crée par Adeline et Nicolas :
setcluspack
cluspackX
Il existe aussi une variante de clustering itérative en ligne de commande: (cet exemple lancera 10 fois un clustering kMeans)
/biolo/cluspack/cluspacksucc.tcl myDataForClustering.txt kmeans 10
Attention : cluspack marche seulement sur des serveurs "star" et plus sur beaufort !!
