Difference between revisions of "GeneQuid"

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GeneQuid est une implémentation en [[CafeDesSciences]] des programmes qui permettent d'interroger rapidement et facilement les bases de données [[UniprotData]], [[InterproData]], et autres...
 
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En fait GeneQuid est comme Gscope (il est d'ailleurs sourcé par Gscope)
 
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les procédures qui sont listées snt appelable avec les paramètres indiqués, le petit help qui suit donne quelques exemples
 

Revision as of 18:00, 15 July 2020

GeneQuid est une implémentation en CafeDesSciences des programmes qui permettent d'interroger rapidement et facilement les bases de données UniprotData, InterproData, et autres...

Résumé

Pour voir ce qui est disponible

 http://lbgi.fr/wscoperr?GeneQuid&Help

les procédures qui sont listées snt appelable avec les paramètres indiqués, le petit help qui suit donne quelques exemples

Comment ça marche

GeneQuid s'utilise

  • en ligne de commande
 /biolo/wscope/genequid/bin/qdsgenequid UniprotData P12345
    ou  plus simplement après s'être mis dans l'environnement GeneQuid par setgenequid (en tcsh) ou module load genequid (en bash)
 qgq UniprotData P12345
    (qgq signifie Question à GeneQuid)
  • directement en Tcl
 GeneQuid UniprotData P12345
  • par web
 http://lbgi.fr/wscoperr?GeneQuid&UniprotData&P12345

En fait GeneQuid est comme Gscope (il est d'ailleurs sourcé par Gscope) ON peut faire

 genequid puts Help
 genequid puts UniprotData P12345

qgq utilisant les café des sciences n efait que de lancer genequid en café des sciences