Difference between revisions of "Java"
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***[http://www-bio3d-igbmc.u-strasbg.fr/~dkieffer/sourceJava/TestProgRunner.htm Petit test] | ***[http://www-bio3d-igbmc.u-strasbg.fr/~dkieffer/sourceJava/TestProgRunner.htm Petit test] | ||
***[http://www-bio3d-igbmc.u-strasbg.fr/~dkieffer/sourceJava/Clustalw.htm Exemple pour faire des clustalw] | ***[http://www-bio3d-igbmc.u-strasbg.fr/~dkieffer/sourceJava/Clustalw.htm Exemple pour faire des clustalw] | ||
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| + | *Fonction BioJava utiles | ||
| + | **[http://www-bio3d-igbmc.u-strasbg.fr/~dkieffer/Librairie/librairie.html#getAlignmentFromFileMSF Recuperer simplement un objet Alignment d'un fichier MSF.] | ||
| + | **[http://www-bio3d-igbmc.u-strasbg.fr/~dkieffer/Librairie/librairie.html#getAlignmentMap l'Alignment en Map.] | ||
| + | **[http://www-bio3d-igbmc.u-strasbg.fr/~dkieffer/Librairie/librairie.html#writeAlignmentInRSF Enregistre un alignement en format rsf.] | ||
==Librairies internes== | ==Librairies internes== | ||
Revision as of 18:33, 20 June 2006
langage de programmation orientée objet.
Disponible en 1.4 pour l'instant sur alnitak et dans "/usr/opt/java141/bin" sur beaufort.
Installé sur star6 en version 1.5 dans /usr/java/jre1.5.0_06/bin/java pour le jre et /usr/java/jdk1.5.0_06/bin/java pour le jdk.
sources internes
- Lancement et synchronisation de programmes externes à partir de java:
- Fonction BioJava utiles
Librairies internes
ToolsFile Pour manipuler les fichiers.
Jama1.4 Pour le calcul matriciel en Java1.4.
