Travaux pratiques de programmation du mardi 11 avril 2017. Traduction adn en proteine.
On se propose d'écrire les procédures qui permettent de convertir une séquence nucléotiques en protéine
Le programme principal Traduction.tcl demande le nom du fichier à traduire.
Ce peut être un fichier au format FASTA ou EMBL
Les procédures se trouvent dans CG_Procedures.tcl
On crée une procédure AAduCodon qui :
- lit le fichier "/home/ripp/www/PublicDirectory/TclRipp/CodeGenetique.txt
- puis mémorise l'acide aminé associé à chaque codon
- rend le aa correspondant
On l'appelle par AAduCodon $Codon
Et une procédure SequenceDuFichier qui rend la séquence en format FASTA ou EMBL
Bonne lecture !
Raymond Ripp