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La base de données Mysql de Wikili (wikidb) est hébergée par kilida depuis le 2012/03/12. Raymond

LBGI

Vous êtes ici sur wikili le serveur wiki du LBGI BioInformatique et Génomique Intégratives

Voir également lbgiki, le wiki privé resteint aux membres de l'équipe.

LBGI est un acronyme récursif qui signifie LBGI Bioinformatique et Génomique Intrégratives

Progiciels

Quel outil utilise quel outil ?

• BIRD Biological Integration and Retrivial Data
• Gscope en général
  • ... et Gscope Clonage en particulier
• Café des sciences
• Subversion, notre outil de versionning
• obsolete: CVS Pour récupérer les dernières versions stables de programmes enregistrés sur le dépot.
• MACSIMS
• RReportGenerator .. c'est un graphical user interface pour des analyses statistiques avec rapports automatiques pour des applications de routine ..
• String nos outils pour s'en servir facilement
• Vep Variant Effect Predictor
• Neopipe Workflow for protein family analysis. A major update of PipeAlign

Serveur et données

• Configuration minimale
• Installation PHP
• Où en sont nos serveurs Star, StarV, Surf, Lame1-14 Kilida et Alnitak et Eyear et Moby
• Source de données ... tous nos serveurs et bases de données
• Tout sur UCSCGenomes

Thématiques et Projets

Voir aussi la liste mise à jour dynamiquement des Thématiques du LBGI et visiter le site DBGS

• MicroVesicles stage de Anaïs Nicol
• Alvinella
• Fed Federating data a common achitecture to manage websites such as
  • Genoret
  • CSTB
  • DBGS
  • Gx and its database GxDb
  • IdV for the Institut de la Vision
• ImAnno a web based annotation tool with a powerfull search engine
• GenoretGenes
• RetinoBase
• CADO4MI
• MAGOS
• JavOO

Outils programmation et Unix

• ssh
• Tcl/Tk
• Java
• aide Unix
• Html et Javascript
• logiciels disponibles sur les serveurs.
• Bibliothèque interne